RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, humanhuman

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13-209ENST00000511467 AUHQ13825 339 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 QPCTQ16769 361 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 THAP5Q7Z6K1 395 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DENND1CQ8IV53 801 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 LRRC17Q8N6Y2 441 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 BPIFB1Q8TDL5 484 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 MPP4Q96JB8 637 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DGAT2Q96PD7 388 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PNKPQ96T60 521 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 MND1Q9BWT6 205 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 SYT4Q9H2B2 425 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 OXSMQ9NWU1 459 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 FZD4Q9ULV1 537 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 LRRC37A2A6NM11 1700 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 FAM159BA6NKW6 160 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 IDH3BO43837 385 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 TPPPO94811 219 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PGLSO95336 258 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 FGF4P08620 206 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RPS7P62081 194 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RPP30P78346 268 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 GPLD1P80108 840 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DAB2P98082 770 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 SLC18A2Q05940 514 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 LRRC14Q15048 493 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 HECTD2Q5U5R9 776 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 TMEM154Q6P9G4 183 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 USP51Q70EK9 711 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 TSTD1Q8NFU3 115 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 OR9A4Q8NGU2 314 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 FIBINQ8TAL6 211 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PPP1R35Q8TAP8 253 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 MAPK15Q8TD08 544 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 SLC35F5Q8WV83 523 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PCED1BQ96HM7 432 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 USF3Q68DE3 2245 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 CLCA1A8K7I4 914 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 A8MVJ9 347 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 D6RAR5 112 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 CASKO14936 926 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DLX3O60479 287 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PRAMEF11O60813 436 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ADAMTS4O75173 837 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PSMG1O95456 288 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 GIMD1P0DJR0 217 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RHCEP18577 417 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 BMP8BP34820 402 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PTSQ03393 145 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 FOLH1Q04609 750 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PRKCZQ05513 592 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PM20D1Q6GTS8 502 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 KMT5CQ86Y97 462 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 HPS6Q86YV9 775 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 C4orf33Q8N1A6 199 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 TPK1Q9H3S4 243 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 NIPAL2Q9H841 368 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 KLHL13Q9P2N7 655 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 MMACHCQ9Y4U1 282 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 DCLK1O15075 740 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RLN2P04090 185 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 IFNA6P05013 189 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 GM2AP17900 193 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RBL1P28749 1068 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ZBTB6Q15916 424 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 LIN52Q52LA3 116 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 SLC22A10Q63ZE4 541 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 Q8N402 240 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 COX18Q8N8Q8 333 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 OR5L1Q8NGL2 311 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 MVB12AQ96EY5 273 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPN13-209ENST00000511467 ZNF559Q9BR84 538 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms