RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496050.1

SSR3-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 3, human

TSL 4 BASIC

Gene SSR3, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR3-208	ENST00000496050	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	MGARP	Q8TDB4	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSR3-208	ENST00000496050	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	EXTL3	O43909	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PCDH7	O60245	1069 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NGF	P01138	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NME5	P56597	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ARF5	P84085	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ABR	Q12979	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CCDC6	Q16204	474 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ARL10	Q8N8L6	244 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SNX21	Q969T3	373 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GIMAP5	Q96F15	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ABCC9	O60706	1549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	TTI1	O43156	1089 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GLCE	O94923	617 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	IGLV2-11	P01706	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	STMN1	P16949	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SERPINB6	P35237	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	OR3A1	P47881	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SLC34A1	Q06495	639 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	AP1B1	Q10567	949 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RPA4	Q13156	261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	P2RY6	Q15077	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SUSD6	Q92537	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM149A	A5PLN7	773 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SCO2	O43819	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SLC22A3	O75751	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KRT33A	O76009	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	EML2	O95834	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	YES1	P07947	543 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	PRKAR1A	P10644	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KRT3	P12035	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	MAGEA11	P43364	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NPRL3	Q12980	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CBX3	Q13185	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SGCG	Q13326	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	TEAD2	Q15562	447 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SGCB	Q16585	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SSR3-208	ENST00000496050	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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