RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 RGPD2P0DJD1 1756 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 REM1O75628 298 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 SDC2P34741 201 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 AHSA2Q719I0 299 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 SLC29A4Q7RTT9 530 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TRIM8Q9BZR9 551 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 UTS2RQ9UKP6 389 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 A0A0G2JN53 185 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 MAN2B1O00754 1011 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 HNF1BP35680 557 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 NDUFA5Q16718 116 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 RTP2Q5QGT7 225 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 GPER1Q99527 375 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 VEGFDO43915 354 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 ZNF823P16415 610 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 GSTM3P21266 225 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 ATP4BP51164 291 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 LIN52Q52LA3 116 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 OR4F3Q6IEY1 312 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 FAM156AQ8NDB6 213 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 GLYATL1Q969I3 302 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 RNF31Q96EP0 1072 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 OR52B2Q96RD2 323 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TMEM138Q9NPI0 162 aa16.59■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 KCNA5P22460 613 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 RPL10P27635 214 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 ELOA3BQ3SY89 546 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 BICRALQ6AI39 1079 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 FRMD7Q6ZUT3 714 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 ELOA3Q8NG57 546 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 MRGPRX2Q96LB1 330 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 COL21A1Q96P44 957 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 IFT27Q9BW83 186 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.58■□□□□ 0.25
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PP18 115 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 OR5K4A6NMS3 321 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PSMD11O00231 422 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 HOXC12P31275 282 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CCNIQ14094 377 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ZNF678Q5SXM1 525 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 NEK7Q8TDX7 302 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 E7ESA3 106 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MAFKO60675 156 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CBFA2T3O75081 653 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CTSAP10619 480 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 OLIG2Q13516 323 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KCTD21Q4G0X4 260 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PERM1Q5SV97 790 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 FRRS1Q6ZNA5 592 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RHEBL1Q8TAI7 183 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 LMX1AQ8TE12 382 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 NR4A3Q92570 626 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RENP00797 406 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RASGRP3Q8IV61 690 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 COQ10BQ9H8M1 238 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MCM8Q9UJA3 840 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 SERTAD3Q9UJW9 196 aa16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TIMP1P01033 207 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 ELOCQ15369 112 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 LIPJQ5W064 366 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TSPEARQ8WU66 669 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 PMEPA1Q969W9 287 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 OR2M4Q96R27 311 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 KXD1Q9BQD3 176 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 COMMD4Q9H0A8 199 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 Q9N2J8 555 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 MKL2Q9ULH7 1088 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.57■□□□□ 0.242e-6■□□□□ 11.2
NISCH-213ENST00000489895 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 TCHHQ07283 1943 aa16.57■□□□□ 0.24
NISCH-213ENST00000489895 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.57■□□□□ 0.24
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