RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MASP2O00187 686 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSVO60911 334 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NIPSNAP2O75323 286 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP11P24347 488 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMB5P28074 263 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKG7Q16617 165 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYSND1Q2T9J0 566 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM214AQ32MH5 1076 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGFL3Q6UXB1 125 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCKQ8N0W5 287 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TM9SF4Q92544 642 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC26A1Q9H2B4 701 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC23Q9UJX2 597 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLK4Q9Y5K2 254 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM169AQ9Y6X4 670 aa25.08■■□□□ 1.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FITM1A5D6W6 292 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCP11X1B4DZS4 312 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESR1P03372 595 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCR5P32302 372 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TERF1P54274 439 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SARNPP82979 210 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX15Q7KZN9 410 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2L3Q8NG85 312 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXL4Q9UKA2 621 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYL1Q9Y2S2 319 aa25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHRM3P20309 590 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5DP30049 168 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GBX1Q14549 363 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WASHC2DQ5SRD0 308 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZADH2Q8N4Q0 377 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRELID2Q8N945 189 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2A1Q8NGT9 310 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM136AQ96C01 138 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPSB2Q99619 263 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC6A20Q9NP91 592 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESPL1Q14674 2120 aa25.06■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP210LQ5VU65 1888 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A1W2PPV9 198 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MATN4O95460 622 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAMP19021 973 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OGNP20774 298 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGA3P26006 1051 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1D4P47884 311 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS41P49754 854 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADARP55265 1226 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNJ11Q14654 390 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMPD2BQ6IN97 320 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf60Q96EN9 201 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTSFQ9UBX1 484 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCM1Q15154 2024 aa25.05■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0J9YVX5 310 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HYKKA2RU49 373 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AVILO75366 819 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPS1Q13098 491 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAA25Q14CX7 972 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC3Q5W041 872 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CASC4Q6P4E1 433 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR9A1PQ8NGU1 263 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSC4DQ8WTU2 575 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa25.04■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 E5RI56 91 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOCS6O14544 535 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEMA7AO75326 666 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PKMP14618 531 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CMPK1P30085 196 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEA6P43360 314 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACSBG2Q5FVE4 666 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEPROQ6NW34 567 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF44Q7L0R7 432 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACAT2Q9BWD1 397 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASF1BQ9NVP2 202 aa25.03■■□□□ 1.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.4 ms