RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 SMU1Q2TAY7 513 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GGTA1PQ4G0N0 100 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SYTL3Q4VX76 610 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 RASGRP3Q8IV61 690 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SLC22A15Q8IZD6 547 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ARRDC3Q96B67 414 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 LRIG1Q96JA1 1093 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 IKZF5Q9H5V7 419 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 CLMPQ9H6B4 373 aa17.61■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 LRRK1Q38SD2 2015 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 K7ESM1 405 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 WNT9AO14904 365 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 KCNH1O95259 989 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 B3GALT4O96024 378 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PGRP06401 933 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GSTM1P09488 218 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SMIM18P0DKX4 95 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 TACR1P25103 407 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PEX19P40855 299 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 AP1S2P56377 157 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GSTM4Q03013 218 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GTDC1Q4AE62 458 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 LDLRAP1Q5SW96 308 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 L3MBTL4Q8NA19 623 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ZFAND2BQ8WV99 257 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 APIPQ96GX9 242 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GBP5Q96PP8 586 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 VPS35Q96QK1 796 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 MUC13Q9H3R2 512 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ASIC5Q9NY37 505 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SNX6Q9UNH7 406 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 AP1G1O43747 822 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GPIP06744 558 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 CD22P20273 847 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 NFKBIAP25963 317 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PDHA2P29803 388 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PRLHRP49683 370 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 CHIT1Q13231 466 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 FXNQ16595 210 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 MAPKAPK3Q16644 382 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 TTC23LQ6PF05 361 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 TMEM220Q6QAJ8 160 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 NEK10Q6ZWH5 1172 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 MSRB3Q8IXL7 192 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 DTWD1Q8N5C7 304 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 BIRC7Q96CA5 298 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SEPHS2Q99611 448 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 RAD18Q9NS91 495 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SLC6A13Q9NSD5 602 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa17.6■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ATG13O75143 517 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 SOD1P00441 154 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 FASP25445 335 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 VASPP50552 380 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 RPS14P62263 151 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PHC1P78364 1004 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 C9orf64Q5T6V5 341 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GLYATQ6IB77 296 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 IYDQ6PHW0 289 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 CYP2U1Q7Z449 544 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GOLM1Q8NBJ4 401 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 TRPV3Q8NET8 790 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 TMEM159Q96B96 161 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 FBXL8Q96CD0 374 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 DTD2Q96FN9 168 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 TSSK3Q96PN8 268 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 USP34Q70CQ2 3546 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PGM3O95394 542 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 EGFP01133 1207 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ZP2Q05996 745 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ZNF234Q14588 700 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PYCR3Q53H96 274 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 CBR4Q8N4T8 237 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 HCAR2Q8TDS4 363 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 MED8Q96G25 268 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 COQ10AQ96MF6 247 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ZNF583Q96ND8 569 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 OR52E6Q96RD3 313 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ETAA1Q9NY74 926 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 THEGQ9P2T0 379 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 GULP1Q9UBP9 304 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 ANAPC2Q9UJX6 822 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa17.59■□□□□ 0.41
USP18-201ENST00000215794 A0A1B0GTW7 788 aa17.58■□□□□ 0.4
USP18-201ENST00000215794 SLC5A10A0PJK1 596 aa17.58■□□□□ 0.4
USP18-201ENST00000215794 E7EQ34 232 aa17.58■□□□□ 0.4
USP18-201ENST00000215794 H0YJX3 145 aa17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms