RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-216	ENST00000628306	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	KDR	P35968	1356 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	GNPAT	O15228	680 aa		33.01	■■■□□ 2.88
CAPNS1-216	ENST00000628306	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	ATP6V1A	P38606	617 aa		33	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.99	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.98	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CAPNS1-216	ENST00000628306	MMP10	P09238	476 aa		32.95	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	32.94	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CAPNS1-216	ENST00000628306	KIF3C	O14782	793 aa		32.88	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	HSPA6	P17066	643 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	DCAF5	Q96JK2	942 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	GYS1	P13807	737 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	ADRA2B	P18089	450 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	TGFB2	P61812	414 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	IFFO2	Q5TF58	517 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CAPNS1-216	ENST00000628306		A0A0G2JLW4	131 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	PANK3	Q9H999	370 aa		32.82	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	DPEP1	P16444	411 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	KCNA3	P22001	575 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CAPNS1-216	ENST00000628306	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	BCS1L	Q9Y276	419 aa		32.76	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	CABP4	P57796	275 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	TJP1	Q07157	1748 aa		32.75	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	RFC4	P35249	363 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	MTHFS	P49914	203 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
CAPNS1-216	ENST00000628306	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	DDR1	Q08345	913 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.69	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	IL13	P35225	146 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	FKBP8	Q14318	412 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	FCHSD2	O94868	740 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	MORC1	Q86VD1	984 aa		32.65	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CAPNS1-216	ENST00000628306	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	TOMM70	O94826	608 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	TM4SF1	P30408	202 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	MIER1	Q8N108	512 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	MRC1	P22897	1456 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	PIM2	Q9P1W9	311 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CAPNS1-216	ENST00000628306	APLP1	P51693	650 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	CHRNA5	P30532	468 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.56	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.52	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		32.52	■■■□□ 2.8
CAPNS1-216	ENST00000628306	SBF1	O95248	1867 aa		32.52	■■■□□ 2.8

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