RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588918.5

MFSD12-208, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 12, human

TSL 5

Gene MFSD12, Length 2,040 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD12-208	ENST00000588918	BTBD11	A6QL63	1104 aa		32.93	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.93	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.92	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	KCNQ3	O43525	872 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		32.91	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		32.9	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	32.9	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	32.89	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		32.89	■■■□□ 2.86
MFSD12-208	ENST00000588918	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	DDB1	Q16531	1140 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	CABP4	P57796	275 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		32.87	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.86	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.84	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	TNS2	Q63HR2	1409 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.83	■■■□□ 2.85
MFSD12-208	ENST00000588918	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.82	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	MSH5	O43196	834 aa		32.82	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		32.81	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918		A0A0G2JS52	829 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF428	Q96B54	188 aa		32.8	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	MRC1	P22897	1456 aa		32.79	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF790	Q6PG37	636 aa		32.78	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	32.77	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	BCL11A	Q9H165	835 aa		32.77	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
MFSD12-208	ENST00000588918	NECTIN2	Q92692	538 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		32.76	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	TNN	Q9UQP3	1299 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	ATRN	O75882	1429 aa		32.75	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		32.74	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	GLI3	P10071	1580 aa		32.73	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		32.72	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		32.7	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.7	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
MFSD12-208	ENST00000588918	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		32.7	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		32.7	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.69	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	PANK1	Q8TE04	598 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	PIGB	Q92521	554 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	CRBN	Q96SW2	442 aa		32.69	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		32.68	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	KIF16B	Q96L93	1317 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	SLC4A2	P04920	1241 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		32.67	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		32.66	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.66	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	RLBP1	P12271	317 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	TRIM27	P14373	513 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.65	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.64	■■■□□ 2.82
MFSD12-208	ENST00000588918	ITGB4	P16144	1822 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	HOXB7	P09629	217 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	STK31	Q9BXU1	1019 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		32.63	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		32.62	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	FAM182B	Q5T319	152 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	G2E3	Q7L622	706 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.61	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	BCL9	O00512	1426 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		32.6	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	32.6	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	ATG3	Q9NT62	314 aa		32.59	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	32.58	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		32.58	■■■□□ 2.81
MFSD12-208	ENST00000588918	USP16	Q9Y5T5	823 aa		32.57	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	KCNQ2	O43526	872 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	ANXA1	P04083	346 aa		32.56	■■■□□ 2.8
MFSD12-208	ENST00000588918	PAPPA	Q13219	1627 aa		32.55	■■■□□ 2.8

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