RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557673.5

NEK9-211, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 3

Gene NEK9, Length 657 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-211ENST00000557673 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.71■■□□□ 1.23
NEK9-211ENST00000557673 IGSF1Q8N6C5 1336 aa22.71■■□□□ 1.23
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NEK9-211ENST00000557673 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
NEK9-211ENST00000557673 IFFO2Q5TF58 517 aa22.68■■□□□ 1.22
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NEK9-211ENST00000557673 ITPK1Q13572 414 aa22.67■■□□□ 1.22
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NEK9-211ENST00000557673 ATG3Q9NT62 314 aa22.67■■□□□ 1.22
NEK9-211ENST00000557673 ADCY9O60503 1353 aa22.66■■□□□ 1.22
NEK9-211ENST00000557673 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.66■■□□□ 1.22
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NEK9-211ENST00000557673 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.64■■□□□ 1.21
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NEK9-211ENST00000557673 ADRA2BP18089 450 aa22.63■■□□□ 1.21
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NEK9-211ENST00000557673 TGFB2P61812 414 aa22.62■■□□□ 1.21
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NEK9-211ENST00000557673 RFC4P35249 363 aa22.58■■□□□ 1.21
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NEK9-211ENST00000557673 MTHFSP49914 203 aa22.54■■□□□ 1.2
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NEK9-211ENST00000557673 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.51■■□□□ 1.19
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NEK9-211ENST00000557673 C4AP0C0L4 1744 aa22.45■■□□□ 1.19
NEK9-211ENST00000557673 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.19
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NEK9-211ENST00000557673 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.34■■□□□ 1.17
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NEK9-211ENST00000557673 RNF181Q9P0P0 153 aa22.33■■□□□ 1.17
NEK9-211ENST00000557673 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
NEK9-211ENST00000557673 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
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