RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 ATP6V1AP38606 617 aa43.76■■■■■ 4.6
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TTC7B-202ENST00000553948 MSL1Q68DK7 614 aa43.75■■■■■ 4.59
TTC7B-202ENST00000553948 CABP4P57796 275 aa43.74■■■■■ 4.59
TTC7B-202ENST00000553948 ITPK1Q13572 414 aa43.74■■■■■ 4.59
TTC7B-202ENST00000553948 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
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TTC7B-202ENST00000553948 PHF14O94880 888 aa43.7■■■■■ 4.59
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TTC7B-202ENST00000553948 ZNF831Q5JPB2 1677 aa43.65■■■■■ 4.58
TTC7B-202ENST00000553948 GNPATO15228 680 aa43.65■■■■■ 4.58
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TTC7B-202ENST00000553948 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa43.62■■■■■ 4.57
TTC7B-202ENST00000553948 SLC4A9Q96Q91 983 aa43.62■■■■■ 4.57
TTC7B-202ENST00000553948 GPR162Q16538 588 aa43.59■■■■■ 4.57
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TTC7B-202ENST00000553948 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
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TTC7B-202ENST00000553948 SLC52A2Q9HAB3 445 aa43.5■■■■■ 4.55
TTC7B-202ENST00000553948 CD2APQ9Y5K6 639 aa43.5■■■■■ 4.55
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TTC7B-202ENST00000553948 RPS6KA4O75676 772 aa43.43■■■■■ 4.54
TTC7B-202ENST00000553948 UTRNP46939 3433 aa43.42■■■■■ 4.54
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TTC7B-202ENST00000553948 TJP1Q07157 1748 aa43.4■■■■■ 4.54
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP43.4■■■■■ 4.54
TTC7B-202ENST00000553948 CRKLP46109 303 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
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TTC7B-202ENST00000553948 MMP10P09238 476 aa43.35■■■■■ 4.53
TTC7B-202ENST00000553948 NLGN1Q8N2Q7 840 aa43.35■■■■■ 4.53
TTC7B-202ENST00000553948 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP43.34■■■■■ 4.53
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TTC7B-202ENST00000553948 IL17REQ8NFR9 667 aa43.24■■■■■ 4.51
TTC7B-202ENST00000553948 PHACTR3Q96KR7 559 aa43.24■■■■■ 4.51
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TTC7B-202ENST00000553948 COL15A1P39059 1388 aa43.07■■■■■ 4.49
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TTC7B-202ENST00000553948 HEG1Q9ULI3 1381 aa43.06■■■■■ 4.48
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