RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTRH1-208	ENST00000543175	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.21	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		32.21	■■■□□ 2.75
PTRH1-208	ENST00000543175	ATP6V1A	P38606	617 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	MTHFS	P49914	203 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	ITPK1	Q13572	414 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		32.19	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		32.18	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	32.18	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	PHF14	O94880	888 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	SSFA2	P28290	1259 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.16	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		32.15	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	CABP4	P57796	275 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	SMIM5	Q71RC9	77 aa		32.14	■■■□□ 2.74
PTRH1-208	ENST00000543175	GPR162	Q16538	588 aa		32.13	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	GNPAT	O15228	680 aa		32.12	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.1	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	TJP1	Q07157	1748 aa		32.08	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
PTRH1-208	ENST00000543175	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	HMOX1	P09601	288 aa		32.07	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.06	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.05	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	MRC1	P22897	1456 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.03	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.03	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PTRH1-208	ENST00000543175	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	31.97	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	ADRA2B	P18089	450 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	LGR6	Q9HBX8	967 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	UTRN	P46939	3433 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PTRH1-208	ENST00000543175	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	GRIN3B	O60391	1043 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		31.93	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	MMP10	P09238	476 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	31.91	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	RFC4	P35249	363 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PTRH1-208	ENST00000543175	GYS1	P13807	737 aa		31.87	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	CFAP53	Q96M91	514 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC39A6	Q13433	755 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PTRH1-208	ENST00000543175	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	PPP2R1A	P30153	589 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PTRH1-208	ENST00000543175	PRKAR2B	P31323	418 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	NUDC	Q9Y266	331 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	TGFB2	P61812	414 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	TEF	Q10587	303 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	FKBP8	Q14318	412 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	COL15A1	P39059	1388 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	31.7	■■■□□ 2.67
PTRH1-208	ENST00000543175	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PTRH1-208	ENST00000543175	ATP10D	Q9P241	1426 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PTRH1-208	ENST00000543175	ZPR1	O75312	459 aa		31.68	■■■□□ 2.66

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