RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536159.2

CITED2-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene CITED2, Length 1,797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-202ENST00000536159 SLC52A2Q9HAB3 445 aa27.36■■□□□ 1.97
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CITED2-202ENST00000536159 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.35■■□□□ 1.97
CITED2-202ENST00000536159 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa27.35■■□□□ 1.97
CITED2-202ENST00000536159 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa27.35■■□□□ 1.97
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CITED2-202ENST00000536159 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
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CITED2-202ENST00000536159 ERVV-2B6SEH9 535 aa27.26■■□□□ 1.95
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CITED2-202ENST00000536159 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
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CITED2-202ENST00000536159 TMEM57Q8N5G2 664 aa27.22■■□□□ 1.95
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CITED2-202ENST00000536159 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.22■■□□□ 1.95
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CITED2-202ENST00000536159 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.18■■□□□ 1.94
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CITED2-202ENST00000536159 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 SLC4A10Q6U841 1118 aa27.07■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.07■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.07■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 USP16Q9Y5T5 823 aa27.07■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
CITED2-202ENST00000536159 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.05■■□□□ 1.92
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