RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NLGN1Q8N2Q7 840 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DCAF5Q96JK2 942 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa14.59□□□□□ -0.07
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP27B1O15528 508 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RASSF7Q02833 373 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHRNA5P30532 468 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AIDAQ96BJ3 306 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABHD8Q96I13 439 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CGNL1Q0VF96 1302 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD163L1Q9NR16 1453 aa14.57□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LBX1P52954 281 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GLTPD2A6NH11 291 aa14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COG3Q96JB2 828 aa14.55□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GYS1P13807 737 aa14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RFC4P35249 363 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CREBZFQ9NS37 354 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TERF2IPQ9NYB0 399 aa14.53□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1W2PP64 1363 aa14.52□□□□□ -0.08
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4AP0C0L4 1744 aa14.51□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ITGB4P16144 1822 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POTECB2RU33 542 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LMNB1P20700 586 aa14.5□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VEGFBP49765 207 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFAP44Q96MT7 982 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATG3Q9NT62 314 aa14.49□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SBF1O95248 1867 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNTNAP1P78357 1384 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POTEIP0CG38 1075 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POTEJP0CG39 1038 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHADLQ6NUI6 762 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDR1Q08345 913 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FKBP8Q14318 412 aa14.47□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WBP1LQ9NX94 342 aa14.46□□□□□ -0.09
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPS6KA4O75676 772 aa14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADRA2BP18089 450 aa14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPG7Q9UQ90 795 aa14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTL1A6NKG5 1358 aa14.44□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GGNBP2Q9H3C7 697 aa14.43□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS19P49795 217 aa14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFKBIEO00221 500 aa14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.41□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERFEQ4G0M1 354 aa14.4□□□□□ -0.1
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 INSRP06213 1382 aa14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDRP35968 1356 aa14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PHKG2P15735 406 aa14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TTLL6Q8N841 843 aa14.39□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PASKQ96RG2 1323 aa14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FYB1O15117 783 aa14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TM4SF1P30408 202 aa14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.37□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FLT4P35916 1363 aa14.36□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.36□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRM1Q13255 1194 aa14.36□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NEUROD1Q13562 356 aa14.36□□□□□ -0.11
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 115.5 ms