RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523936.5

RPS20-210, Transcript of ribosomal protein S20, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RPS20, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS20-210ENST00000523936 ATG3Q9NT62 314 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS20-210ENST00000523936 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
RPS20-210ENST00000523936 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.59■■□□□ 1.85
RPS20-210ENST00000523936 GNPATO15228 680 aa26.58■■□□□ 1.85
RPS20-210ENST00000523936 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
RPS20-210ENST00000523936 KDRP35968 1356 aa26.58■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.53■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.52■■□□□ 1.84
RPS20-210ENST00000523936 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.51■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 CLSPNQ9HAW4 1339 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 MMP10P09238 476 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 C4AP0C0L4 1744 aa26.5■■□□□ 1.83
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RPS20-210ENST00000523936 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 DCAF5Q96JK2 942 aa26.49■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.48■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 ADRA2BP18089 450 aa26.47■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.47■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 TGFB2P61812 414 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS20-210ENST00000523936 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 HSPA6P17066 643 aa26.44■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.44■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 RPS6KA4O75676 772 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 PANK3Q9H999 370 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 GYS1P13807 737 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 KIF3CO14782 793 aa26.41■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 CABP4P57796 275 aa26.41■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 TJP1Q07157 1748 aa26.4■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 A0A0G2JLW4 131 aa26.39■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 RFC4P35249 363 aa26.39■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.39■■□□□ 1.82
RPS20-210ENST00000523936 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
RPS20-210ENST00000523936 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
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RPS20-210ENST00000523936 BCS1LQ9Y276 419 aa26.38■■□□□ 1.81
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RPS20-210ENST00000523936 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.35■■□□□ 1.81
RPS20-210ENST00000523936 DPEP1P16444 411 aa26.35■■□□□ 1.81
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RPS20-210ENST00000523936 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.34■■□□□ 1.81
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RPS20-210ENST00000523936 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
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RPS20-210ENST00000523936 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.32■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 FCHSD2O94868 740 aa26.31■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.31■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 IL13P35225 146 aa26.3■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 SBF1O95248 1867 aa26.28■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 TOMM70O94826 608 aa26.27■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 FKBP8Q14318 412 aa26.27■■□□□ 1.8
RPS20-210ENST00000523936 DDR1Q08345 913 aa26.26■■□□□ 1.79
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RPS20-210ENST00000523936 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.26■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.25■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 MRC1P22897 1456 aa26.24■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 APLP1P51693 650 aa26.24■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.23■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.23■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 TM4SF1P30408 202 aa26.22■■□□□ 1.79
RPS20-210ENST00000523936 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.22■■□□□ 1.79
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RPS20-210ENST00000523936 LGR6Q9HBX8 967 aa26.2■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.2■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 WDR90Q96KV7 1748 aa26.19■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.19■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.19■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 ZPR1O75312 459 aa26.17■■□□□ 1.78
RPS20-210ENST00000523936 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
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