RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513056.5

FAM53C-211, Transcript of family with sequence similarity 53 member C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53C, Length 923 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53C-211ENST00000513056 SMIM5Q71RC9 77 aa25.24■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 ATG3Q9NT62 314 aa25.23■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.21■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
FAM53C-211ENST00000513056 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.19■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 PXDNLA1KZ92 1463 aa25.18■■□□□ 1.62
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FAM53C-211ENST00000513056 MMP10P09238 476 aa25.17■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 ADRA2BP18089 450 aa25.17■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 HSPA6P17066 643 aa25.16■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 NLGN1Q8N2Q7 840 aa25.16■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 DCAF5Q96JK2 942 aa25.16■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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FAM53C-211ENST00000513056 TGFB2P61812 414 aa25.15■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.15■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.14■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.14■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 WWC3Q9ULE0 1092 aa25.14■■□□□ 1.62
FAM53C-211ENST00000513056 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
FAM53C-211ENST00000513056 C4AP0C0L4 1744 aa25.14■■□□□ 1.61
FAM53C-211ENST00000513056 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
FAM53C-211ENST00000513056 IFFO2Q5TF58 517 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM53C-211ENST00000513056 SLC4A9Q96Q91 983 aa25.13■■□□□ 1.61
FAM53C-211ENST00000513056 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
FAM53C-211ENST00000513056 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
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FAM53C-211ENST00000513056 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
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FAM53C-211ENST00000513056 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.06■■□□□ 1.6
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FAM53C-211ENST00000513056 PARP3Q9Y6F1 533 aa25.04■■□□□ 1.6
FAM53C-211ENST00000513056 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.03■■□□□ 1.6
FAM53C-211ENST00000513056 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.03■■□□□ 1.6
FAM53C-211ENST00000513056 TJP1Q07157 1748 aa25.03■■□□□ 1.6
FAM53C-211ENST00000513056 MTHFSP49914 203 aa25.02■■□□□ 1.6
FAM53C-211ENST00000513056 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP25.02■■□□□ 1.6
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FAM53C-211ENST00000513056 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa24.98■■□□□ 1.59
FAM53C-211ENST00000513056 MORC1Q86VD1 984 aa24.98■■□□□ 1.59
FAM53C-211ENST00000513056 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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FAM53C-211ENST00000513056 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.95■■□□□ 1.58
FAM53C-211ENST00000513056 PIM2Q9P1W9 311 aa24.95■■□□□ 1.58
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FAM53C-211ENST00000513056 MRC1P22897 1456 aa24.93■■□□□ 1.58
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FAM53C-211ENST00000513056 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.91■■□□□ 1.58
FAM53C-211ENST00000513056 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
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FAM53C-211ENST00000513056 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.87■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 ZPR1O75312 459 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.86■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.85■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.85■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.85■■□□□ 1.57
FAM53C-211ENST00000513056 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.84■■□□□ 1.57
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