RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 GNPATO15228 680 aa17.28■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.28■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 WWC3Q9ULE0 1092 aa17.27■□□□□ 0.36
PRAME-212ENST00000485532 KDRP35968 1356 aa17.27■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 KIF7Q2M1P5 1343 aa17.26■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 SSFA2P28290 1259 aa17.26■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 CD2APQ9Y5K6 639 aa17.26■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 ERVV-2B6SEH9 535 aa17.25■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
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PRAME-212ENST00000485532 SULT6B1Q6IMI4 303 aa17.25■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 DCAF5Q96JK2 942 aa17.25■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 IL13P35225 146 aa17.24■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa17.24■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.23■□□□□ 0.35
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PRAME-212ENST00000485532 ZNF831Q5JPB2 1677 aa17.23■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 GRIN3BO60391 1043 aa17.22■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 MTHFSP49914 203 aa17.22■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 AMOTQ4VCS5 1084 aa17.22■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 C1orf141Q5JVX7 400 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa17.21■□□□□ 0.35
PRAME-212ENST00000485532 SCN11AQ9UI33 1791 aa17.2■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
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PRAME-212ENST00000485532 C1QTNF8P60827 252 aa17.19■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
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PRAME-212ENST00000485532 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 HMOX1P09601 288 aa17.18■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC3LQ5T215 181 aa17.18■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 TJP1Q07157 1748 aa17.18■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
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PRAME-212ENST00000485532 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa17.17■□□□□ 0.34
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PRAME-212ENST00000485532 LGR6Q9HBX8 967 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 KIF13BQ9NQT8 1826 aa17.16■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
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PRAME-212ENST00000485532 CRKLP46109 303 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
PRAME-212ENST00000485532 ATP10DQ9P241 1426 aa17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-212ENST00000485532 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-212ENST00000485532 AKAP4Q5JQC9 854 aa17.14■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
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PRAME-212ENST00000485532 NLGN1Q8N2Q7 840 aa17.12■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.12■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 SLC52A2Q9HAB3 445 aa17.12■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 RNMTO43148 476 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
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PRAME-212ENST00000485532 DNAJC10Q8IXB1 793 aa17.11■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 C10orf71Q711Q0 1435 aa17.11■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa17.1■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 ADCY9O60503 1353 aa17.1■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 MRC1P22897 1456 aa17.1■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 FKBP8Q14318 412 aa17.09■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
PRAME-212ENST00000485532 KCPQ6ZWJ8 1503 aa17.08■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 DPEP1P16444 411 aa17.08■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 CCDC87Q9NVE4 849 aa17.08■□□□□ 0.32
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PRAME-212ENST00000485532 TGFB2P61812 414 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 DDR1Q08345 913 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 BCS1LQ9Y276 419 aa17.07■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 CEP350Q5VT06 3117 aa17.06■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 KCNA3P22001 575 aa17.05■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.05■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa17.04■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 USPL1Q5W0Q7 1092 aa17.04■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 FCHSD2O94868 740 aa17.03■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa17.03■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 TM4SF1P30408 202 aa17.02■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa17.02■□□□□ 0.32
PRAME-212ENST00000485532 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
PRAME-212ENST00000485532 ZPR1O75312 459 aa17.01■□□□□ 0.31
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