RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468310.5

PRKCZ-208, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 5

Gene PRKCZ, Length 690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-208	ENST00000468310	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	IL13	P35225	146 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	ITPK1	Q13572	414 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	SMIM5	Q71RC9	77 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	MTHFS	P49914	203 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	CABP4	P57796	275 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	GNPAT	O15228	680 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	SSFA2	P28290	1259 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PRKCZ-208	ENST00000468310	KDR	P35968	1356 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PRKCZ-208	ENST00000468310	UTRN	P46939	3433 aa		29.14	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	29.14	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	HMOX1	P09601	288 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	29.09	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	GRIN3B	O60391	1043 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PRKCZ-208	ENST00000468310	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	MMP10	P09238	476 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADRA2B	P18089	450 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	LGR6	Q9HBX8	967 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	TJP1	Q07157	1748 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	RPS6KA4	O75676	772 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PRKCZ-208	ENST00000468310	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	RFC4	P35249	363 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	C4A	P0C0L4	1744 aa		29	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		29	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	MRC1	P22897	1456 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		28.96	■■■□□ 2.23
PRKCZ-208	ENST00000468310	GYS1	P13807	737 aa		28.95	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	SLC39A6	Q13433	755 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		28.94	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	CFAP53	Q96M91	514 aa		28.93	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		28.92	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		28.91	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		28.9	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		28.89	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
PRKCZ-208	ENST00000468310	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		28.88	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		28.87	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	TGFB2	P61812	414 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		28.86	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	TEF	Q10587	303 aa		28.85	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	FKBP8	Q14318	412 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	NUDC	Q9Y266	331 aa		28.84	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310		A0A0G2JLW4	131 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	ZPR1	O75312	459 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	PPP2R1A	P30153	589 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	PRKAR2B	P31323	418 aa		28.83	■■■□□ 2.21
PRKCZ-208	ENST00000468310	C1QTNF8	P60827	252 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	ATP10D	Q9P241	1426 aa		28.82	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		28.81	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	BCS1L	Q9Y276	419 aa		28.8	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	COL15A1	P39059	1388 aa		28.79	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
PRKCZ-208	ENST00000468310	DPEP1	P16444	411 aa		28.79	■■■□□ 2.2

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