RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 GNPATO15228 680 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 ATP6V1AP38606 617 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.03■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 ITPK1Q13572 414 aa16.02■□□□□ 0.16
PRAME-210ENST00000442481 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.02■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 ADRA2BP18089 450 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.01■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 PXDNLA1KZ92 1463 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 PHKG2P15735 406 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 TGFB2P61812 414 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 MMP10P09238 476 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 EYA1Q99502 592 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 CARD14Q9BXL6 1004 aa15.99■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.98■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 APLP1P51693 650 aa15.97■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 DCAF5Q96JK2 942 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 ATG3Q9NT62 314 aa15.96■□□□□ 0.15
PRAME-210ENST00000442481 TOMM70O94826 608 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 RFC4P35249 363 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 POLKQ9UBT6 870 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 BCS1LQ9Y276 419 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.95■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 A0A0G2JLW4 131 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 KDRP35968 1356 aa15.94■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.93■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.92■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 C4AP0C0L4 1744 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 RPS6KA4O75676 772 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 FCHSD2O94868 740 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 DPEP1P16444 411 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 CABP4P57796 275 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 GYS1P13807 737 aa15.9■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
PRAME-210ENST00000442481 KCNA3P22001 575 aa15.89■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 WDR90Q96KV7 1748 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 MTHFSP49914 203 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 PANK3Q9H999 370 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 PIM2Q9P1W9 311 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.88■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 HTRA3P83110 453 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.87■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.86■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 FSTL1Q12841 308 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-210ENST00000442481 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 ZPR1O75312 459 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 DDR1Q08345 913 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 MORC1Q86VD1 984 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 KLRG1Q96E93 195 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 FKBP8Q14318 412 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 TJP1Q07157 1748 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 CHRNA5P30532 468 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 JMYQ8N9B5 988 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 RNF181Q9P0P0 153 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 RRAGCQ9HB90 399 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SMC1BQ8NDV3 1235 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-210ENST00000442481 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms