RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

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Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.75■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.74■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.74■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.73■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 HSPA6P17066 643 aa23.73■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.73■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 KDRP35968 1356 aa23.72■■□□□ 1.39
NICN1-204ENST00000436744 KIF3CO14782 793 aa23.7■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.7■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 A0A0G2JLW4 131 aa23.69■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 BCS1LQ9Y276 419 aa23.68■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.67■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.67■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
NICN1-204ENST00000436744 DPEP1P16444 411 aa23.64■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 C4AP0C0L4 1744 aa23.64■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 GYS1P13807 737 aa23.63■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.62■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.62■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.61■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 TGFB2P61812 414 aa23.61■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 NLGN1Q8N2Q7 840 aa23.61■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 DCAF5Q96JK2 942 aa23.61■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.6■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.6■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 RFC4P35249 363 aa23.6■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 CABP4P57796 275 aa23.6■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 RPS6KA4O75676 772 aa23.59■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 FCHSD2O94868 740 aa23.59■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.59■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.59■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
NICN1-204ENST00000436744 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 ADRA2BP18089 450 aa23.57■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 PANK3Q9H999 370 aa23.57■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.57■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 KCNA3P22001 575 aa23.56■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 MTHFSP49914 203 aa23.55■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 TJP1Q07157 1748 aa23.55■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.54■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 FKBP8Q14318 412 aa23.54■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.54■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 DDR1Q08345 913 aa23.53■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.53■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 TOMM70O94826 608 aa23.52■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.52■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.52■■□□□ 1.36
NICN1-204ENST00000436744 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 CHRNA5P30532 468 aa23.51■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 APLP1P51693 650 aa23.51■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.51■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.51■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 HTRA3P83110 453 aa23.5■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 MORC1Q86VD1 984 aa23.49■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.48■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.48■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 PIM2Q9P1W9 311 aa23.48■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.48■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa23.48■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.47■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.47■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 DNAJC10Q8IXB1 793 aa23.46■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 PCNTO95613 3336 aa23.46■■□□□ 1.35
NICN1-204ENST00000436744 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 RNF181Q9P0P0 153 aa23.45■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 WDR90Q96KV7 1748 aa23.45■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 IL13P35225 146 aa23.44■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.44■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 LGR6Q9HBX8 967 aa23.43■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 SLC39A6Q13433 755 aa23.42■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 TM4SF1P30408 202 aa23.41■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 RASSF7Q02833 373 aa23.41■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 RRAGCQ9HB90 399 aa23.41■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 SBF1O95248 1867 aa23.41■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.4■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
NICN1-204ENST00000436744 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NICN1-204ENST00000436744 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NICN1-204ENST00000436744 HMOX1P09601 288 aa23.39■■□□□ 1.33
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