RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416316.1

AC004911.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC004911.1, Length 871 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004911.1-201ENST00000416316 ATG3Q9NT62 314 aa29.11■■■□□ 2.25
AC004911.1-201ENST00000416316 GNPATO15228 680 aa29.1■■■□□ 2.25
AC004911.1-201ENST00000416316 SSFA2P28290 1259 aa29.1■■■□□ 2.25
AC004911.1-201ENST00000416316 IGSF1Q8N6C5 1336 aa29.06■■■□□ 2.24
AC004911.1-201ENST00000416316 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
AC004911.1-201ENST00000416316 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
AC004911.1-201ENST00000416316 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 MORC1Q86VD1 984 aa29.01■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 SLC4A9Q96Q91 983 aa29.01■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 ERVV-2B6SEH9 535 aa29■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 DCAF5Q96JK2 942 aa29■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 ATP10DQ9P241 1426 aa29■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.99■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 KDRP35968 1356 aa28.98■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 MMP10P09238 476 aa28.97■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 CABP4P57796 275 aa28.97■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 TRAPPC3LQ5T215 181 aa28.97■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.96■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
AC004911.1-201ENST00000416316 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.95■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 MTHFSP49914 203 aa28.93■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 C1orf141Q5JVX7 400 aa28.92■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.92■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.92■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.89■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa28.89■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
AC004911.1-201ENST00000416316 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 ADCY9O60503 1353 aa28.88■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 RPS6KA4O75676 772 aa28.88■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 RFC4P35249 363 aa28.88■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa28.88■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.87■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 IL13P35225 146 aa28.87■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 A0A0G2JLW4 131 aa28.86■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 GYS1P13807 737 aa28.86■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.85■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 ADRA2BP18089 450 aa28.85■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 BCS1LQ9Y276 419 aa28.84■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 TGFB2P61812 414 aa28.83■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 KIF13BQ9NQT8 1826 aa28.83■■■□□ 2.21
AC004911.1-201ENST00000416316 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.82■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.82■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa28.82■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 C10orf71Q711Q0 1435 aa28.8■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 DPEP1P16444 411 aa28.8■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 C4AP0C0L4 1744 aa28.8■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 HMOX1P09601 288 aa28.78■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 LGR6Q9HBX8 967 aa28.78■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.77■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 AKAP4Q5JQC9 854 aa28.77■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.77■■■□□ 2.2
AC004911.1-201ENST00000416316 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.76■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 TJP1Q07157 1748 aa28.76■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 FCHSD2O94868 740 aa28.75■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 FKBP8Q14318 412 aa28.75■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 SLC52A2Q9HAB3 445 aa28.74■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 SLC39A6Q13433 755 aa28.73■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 DNAJC10Q8IXB1 793 aa28.73■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 CEP350Q5VT06 3117 aa28.71■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 KIF3CO14782 793 aa28.71■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 KCNA3P22001 575 aa28.71■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 DDR1Q08345 913 aa28.71■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
AC004911.1-201ENST00000416316 HSPA6P17066 643 aa28.7■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.67■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 ZPR1O75312 459 aa28.66■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 PIM2Q9P1W9 311 aa28.66■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 CHRNA5P30532 468 aa28.65■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
AC004911.1-201ENST00000416316 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa28.64■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 TM4SF1P30408 202 aa28.63■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 MRC1P22897 1456 aa28.62■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 C9orf131Q5VYM1 1079 aa28.62■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.61■■■□□ 2.17
AC004911.1-201ENST00000416316 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms