RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 NGLY1Q96IV0 654 aa25.09■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 CALRP27797 417 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 RARSP54136 660 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 AIDAQ96BJ3 306 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 TOPBP1Q92547 1522 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.08■■□□□ 1.61
ANKRD28-201ENST00000399451 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.08■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 ABCC11Q96J66 1382 aa25.07■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 KIAA0754O94854 1291 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 DDX11Q96FC9 970 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 CAMK4Q16566 473 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 NEFHP12036 1026 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 NEBLO76041 1014 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 SCLT1Q96NL6 688 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 MIS18AQ9NYP9 233 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 MCM10Q7L590 875 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC61Q9Y6R9 512 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 TNIP1Q15025 636 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.02■■□□□ 1.6
ANKRD28-201ENST00000399451 DESP17661 470 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CFAP100Q494V2 611 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 RRP9O43818 475 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR78Q5VTH9 848 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 MYD88Q99836 296 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 MKNK2Q9HBH9 465 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 KIAA1328Q86T90 577 aa25■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM193AP78312 1265 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 EIF5P55010 431 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 FERMT3Q86UX7 667 aa24.99■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 PDCL2Q8N4E4 241 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC148Q8NFR7 591 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CENPHQ9H3R5 247 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 ANO10Q9NW15 660 aa24.98■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.97■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 UBXN4Q92575 508 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC102AQ96A19 550 aa24.96■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 CD109Q6YHK3 1445 aa24.95■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
ANKRD28-201ENST00000399451 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 EXOC5O00471 708 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD62A6NC57 917 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.95■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 PTPN14Q15678 1187 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 TAF4BQ92750 862 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 ZSCAN12O43309 604 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 FOXO3O43524 673 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 SKAP1Q86WV1 359 aa24.94■■□□□ 1.58
ANKRD28-201ENST00000399451 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66 ms