RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399208.6

SETD4-205, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD4, Length 1,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-205ENST00000399208 ATG3Q9NT62 314 aa20.37■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 TGFB2P61812 414 aa20.36■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 POLKQ9UBT6 870 aa20.36■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.35■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.35■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.35■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.34■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.34■□□□□ 0.85
SETD4-205ENST00000399208 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.32■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 KDRP35968 1356 aa20.32■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.32■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.31■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 A0A0G2JLW4 131 aa20.31■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 ADRA2BP18089 450 aa20.31■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 BCS1LQ9Y276 419 aa20.31■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 SLC4A9Q96Q91 983 aa20.3■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.3■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 APLP1P51693 650 aa20.29■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 DCAF5Q96JK2 942 aa20.29■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.28■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 TOMM70O94826 608 aa20.28■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 RFC4P35249 363 aa20.28■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.28■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.27■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 RPS6KA4O75676 772 aa20.27■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 GYS1P13807 737 aa20.27■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.27■□□□□ 0.84
SETD4-205ENST00000399208 C4AP0C0L4 1744 aa20.27■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 FCHSD2O94868 740 aa20.26■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 DPEP1P16444 411 aa20.26■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 CABP4P57796 275 aa20.25■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.23■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 KCNA3P22001 575 aa20.22■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.22■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 POLR3GLQ9BT43 218 aa20.22■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.22■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.21■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 PIM2Q9P1W9 311 aa20.21■□□□□ 0.83
SETD4-205ENST00000399208 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.2■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 MTHFSP49914 203 aa20.2■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.19■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.18■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.18■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 FKBP8Q14318 412 aa20.16■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 PANK3Q9H999 370 aa20.15■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.15■□□□□ 0.82
SETD4-205ENST00000399208 WDR90Q96KV7 1748 aa20.14■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 DDR1Q08345 913 aa20.14■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 FSTL1Q12841 308 aa20.14■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 AEBP1Q8IUX7 1158 aa20.14■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 RNF181Q9P0P0 153 aa20.13■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 TJP1Q07157 1748 aa20.13■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 TM4SF1P30408 202 aa20.12■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.12■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 MORC1Q86VD1 984 aa20.12■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 CHRNA5P30532 468 aa20.11■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.11■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 ZPR1O75312 459 aa20.1■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 KLRG1Q96E93 195 aa20.1■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.1■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 SBF1O95248 1867 aa20.09■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 RRAGCQ9HB90 399 aa20.09■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.09■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.08■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.08■□□□□ 0.81
SETD4-205ENST00000399208 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 IL13P35225 146 aa20.07■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 HTRA3P83110 453 aa20.07■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.07■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 JMYQ8N9B5 988 aa20.07■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 CLSPNQ9HAW4 1339 aa20.06■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.06■□□□□ 0.8
SETD4-205ENST00000399208 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 239.5 ms