RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 IL13P35225 146 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 ATP6V1AP38606 617 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 DCAF5Q96JK2 942 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 KDRP35968 1356 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 GNPATO15228 680 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 MTHFSP49914 203 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
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PTPRK-208ENST00000392449 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
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PTPRK-208ENST00000392449 CABP4P57796 275 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 HMOX1P09601 288 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRK-208ENST00000392449 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.53■■□□□ 1.2
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PTPRK-208ENST00000392449 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.52■■□□□ 1.2
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PTPRK-208ENST00000392449 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
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PTPRK-208ENST00000392449 TJP1Q07157 1748 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 LGR6Q9HBX8 967 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 C4AP0C0L4 1744 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 MMP10P09238 476 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRK-208ENST00000392449 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
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PTPRK-208ENST00000392449 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-208ENST00000392449 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.44■■□□□ 1.18
PTPRK-208ENST00000392449 RPS6KA4O75676 772 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-208ENST00000392449 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-208ENST00000392449 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.43■■□□□ 1.18
PTPRK-208ENST00000392449 MRC1P22897 1456 aa22.43■■□□□ 1.18
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PTPRK-208ENST00000392449 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.39■■□□□ 1.17
PTPRK-208ENST00000392449 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.39■■□□□ 1.17
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PTPRK-208ENST00000392449 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.37■■□□□ 1.17
PTPRK-208ENST00000392449 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRK-208ENST00000392449 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-208ENST00000392449 FKBP8Q14318 412 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRK-208ENST00000392449 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRK-208ENST00000392449 A0A0G2JLW4 131 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.33■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 ATP10DQ9P241 1426 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 DDR1Q08345 913 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 IL17REQ8NFR9 667 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 C1QTNF8P60827 252 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.3■■□□□ 1.16
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PTPRK-208ENST00000392449 PRKAR2BP31323 418 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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PTPRK-208ENST00000392449 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 TGFB2P61812 414 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 CFAP53Q96M91 514 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 BCS1LQ9Y276 419 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRK-208ENST00000392449 COL15A1P39059 1388 aa22.27■■□□□ 1.16
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