RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317058.7

SGF29-201, Transcript of SAGA complex associated factor 29, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGF29, Length 1,153 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29-201ENST00000317058 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 TXNRD1Q16881 649 aa22.66■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.65■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.65■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 PALLDQ8WX93 1383 aa22.65■■□□□ 1.22
SGF29-201ENST00000317058 RIPK4P57078 832 aa22.64■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.64■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.64■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.64■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 MCM10Q7L590 875 aa22.63■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 PROM2Q8N271 834 aa22.63■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 ATG3Q9NT62 314 aa22.63■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.62■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 DCTN1Q14203 1278 aa22.61■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 PAPPAQ13219 1627 aa22.6■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 NEUROD2Q15784 382 aa22.6■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 NBPF14Q5TI25 921 aa22.6■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 MIER1Q8N108 512 aa22.6■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 APAF1O14727 1248 aa22.59■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.58■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 SIK1P57059 783 aa22.58■■□□□ 1.21
SGF29-201ENST00000317058 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.57■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.56■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 BTBD11A6QL63 1104 aa22.56■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.56■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.55■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 SLC39A6Q13433 755 aa22.55■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 C5P01031 1676 aa22.55■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.54■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 ATP6V1AP38606 617 aa22.54■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 KCNQ4P56696 695 aa22.54■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 STK32BQ9NY57 414 aa22.54■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.54■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 ZNF790Q6PG37 636 aa22.53■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SGF29-201ENST00000317058 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.52■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 SLC15A2Q16348 729 aa22.5■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.49■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.49■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 C4BP0C0L5 1744 aa22.48■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.48■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 ITPK1Q13572 414 aa22.48■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.48■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.48■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 CCDC27Q2M243 656 aa22.47■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.47■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 AKT1S1Q96B36 256 aa22.47■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.47■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 TJP1Q07157 1748 aa22.47■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 KCNQ3O43525 872 aa22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 ZNF827Q17R98 1081 aa22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 NGEFQ8N5V2 710 aa22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.46■■□□□ 1.19
SGF29-201ENST00000317058 AK7Q96M32 723 aa22.45■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.45■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.45■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.44■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.43■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.43■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.42■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 WWC1Q8IX03 1113 aa22.42■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 CHL1O00533 1208 aa22.41■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 CFAP44Q96MT7 982 aa22.41■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.41■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 STARD3NLO95772 234 aa22.4■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 GNAI1P63096 354 aa22.4■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 IFT57Q9NWB7 429 aa22.4■■□□□ 1.18
SGF29-201ENST00000317058 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.39■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 GNPATO15228 680 aa22.38■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 CASZ1Q86V15 1759 aa22.38■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.37■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 WDR63Q8IWG1 891 aa22.37■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.37■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SGF29-201ENST00000317058 IL16Q14005 1332 aa22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms