RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301323.7

RECQL4-201, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 3

Gene RECQL4, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-201ENST00000301323 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 ITPK1Q13572 414 aa22.17■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.17■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.17■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.16■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 YY1P25490 414 aa22.16■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.16■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 PPP2R1AP30153 589 aa22.15■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 ARXQ96QS3 562 aa22.15■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RECQL4-201ENST00000301323 CABP4P57796 275 aa22.14■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 AK7Q96M32 723 aa22.14■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.14■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 TJP1Q07157 1748 aa22.14■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 ATP6V1AP38606 617 aa22.12■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.12■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 SYT17Q9BSW7 474 aa22.11■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 POLD1P28340 1107 aa22.1■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.1■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 CFAP53Q96M91 514 aa22.1■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 UTRNP46939 3433 aa22.09■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 MSH5O43196 834 aa22.09■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 SSFA2P28290 1259 aa22.09■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 SMIM5Q71RC9 77 aa22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 LGR6Q9HBX8 967 aa22.08■■□□□ 1.13
RECQL4-201ENST00000301323 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 C4AP0C0L4 1744 aa22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 GNPATO15228 680 aa22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 PHF14O94880 888 aa22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 MSL1Q68DK7 614 aa22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.07■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.06■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 PRKAR2BP31323 418 aa22.04■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.04■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.02■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 NUDCQ9Y266 331 aa22.02■■□□□ 1.12
RECQL4-201ENST00000301323 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 GNAT3A8MTJ3 354 aa21.99■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 SLC39A6Q13433 755 aa21.99■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 KLHL34Q8N239 644 aa21.99■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 ADRA2BP18089 450 aa21.98■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 IL17REQ8NFR9 667 aa21.98■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 NLGN2Q8NFZ4 835 aa21.98■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 RPS6KA4O75676 772 aa21.97■■□□□ 1.11
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RECQL4-201ENST00000301323 FCHSD2O94868 740 aa21.96■■□□□ 1.11
RECQL4-201ENST00000301323 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.95■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 CHD4Q14839 1912 aa21.95■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.94■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 TEFQ10587 303 aa21.93■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 KIF13BQ9NQT8 1826 aa21.93■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 RALBP1Q15311 655 aa21.92■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.92■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 CD2APQ9Y5K6 639 aa21.92■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.92■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.91■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 GYS1P13807 737 aa21.91■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.91■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 MMP10P09238 476 aa21.9■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 ZNF790Q6PG37 636 aa21.9■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.89■■□□□ 1.1
RECQL4-201ENST00000301323 RFC4P35249 363 aa21.89■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 TTC5Q8N0Z6 440 aa21.89■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.89■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 COL15A1P39059 1388 aa21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 GPR162Q16538 588 aa21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.87■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 MCM10Q7L590 875 aa21.86■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 SCN7AQ01118 1682 aa21.85■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
RECQL4-201ENST00000301323 PXDNLA1KZ92 1463 aa21.84■■□□□ 1.09
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