RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 EVA1CP58658 441 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 RGS12O14924 1447 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 BTBD11A6QL63 1104 aa11.93□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 ABCC4O15439 1325 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa11.92□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC4A2P04920 1241 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPRIPQ8IWB1 547 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 IGHDP01880 384 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 IL2RBP14784 551 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 AAMPQ13685 434 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 PLCH1Q4KWH8 1693 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 MRC1P22897 1456 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 HEG1Q9ULI3 1381 aa11.91□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 G2E3Q7L622 706 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 USP35Q9P2H5 1018 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX19BQ9UMR2 479 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 CACNA1FO60840 1977 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 DCAF5Q96JK2 942 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 ADAMTS2O95450 1211 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.9□□□□□ -0.5
RABGEF1-201ENST00000284957 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NECTIN2Q92692 538 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NRAPQ86VF7 1730 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 SKAP1Q86WV1 359 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.89□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PTPRCP08575 1304 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 DISP2A7MBM2 1401 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 HOXB7P09629 217 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 CERKQ8TCT0 537 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC39A6Q13433 755 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF790Q6PG37 636 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 STK31Q9BXU1 1019 aa11.87□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 FLIIQ13045 1269 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 WNK3Q9BYP7 1800 aa11.86□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 C5P01031 1676 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 SLIT2O94813 1529 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 F6X3S4 739 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 NWD2Q9ULI1 1742 aa11.85□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 CHPF2Q9P2E5 772 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 GLI3P10071 1580 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 CABP4P57796 275 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 JCADQ9P266 1359 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 ANXA1P04083 346 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf115Q9H7X2 142 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPPAQ13219 1627 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 PROSER3Q2NL68 480 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 UBR2Q8IWV8 1755 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 PDIA6Q15084 440 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 LRP6O75581 1613 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 BCL9LQ86UU0 1499 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP4AQ9BY43 222 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 KCPQ6ZWJ8 1503 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 ITGB4P16144 1822 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 TTC5Q8N0Z6 440 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 MEIS3Q99687 375 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 USP16Q9Y5T5 823 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 TNS2Q63HR2 1409 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 FMNL2Q96PY5 1086 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 PXDNLA1KZ92 1463 aa11.79□□□□□ -0.52
RABGEF1-201ENST00000284957 EXOC5O00471 708 aa11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms