RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215794.7

USP18-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP18, Length 2,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18-201ENST00000215794 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.92■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 SMC5Q8IY18 1101 aa22.9■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.9■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.89■■□□□ 1.26
USP18-201ENST00000215794 NBR1Q14596 966 aa22.89■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 NGLY1Q96IV0 654 aa22.89■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 MEGF6O75095 1541 aa22.88■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 NCAPD2Q15021 1401 aa22.87■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 SLC4A3P48751 1232 aa22.87■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.87■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 NRAPQ86VF7 1730 aa22.86■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 TSPYL4Q9UJ04 414 aa22.85■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 RGS12O14924 1447 aa22.84■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 SLIT2O94813 1529 aa22.84■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa22.84■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
USP18-201ENST00000215794 LRRC37A3O60309 1634 aa22.83■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.82■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.82■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 FBXO41Q8TF61 875 aa22.82■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 NUCB1Q02818 461 aa22.81■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 BCL9LQ86UU0 1499 aa22.81■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.81■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 LNPKQ9C0E8 428 aa22.81■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.79■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 MAP3K5Q99683 1374 aa22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 SLC4A2P04920 1241 aa22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 UNC5CLQ8IV45 518 aa22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 IL17REQ8NFR9 667 aa22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 USP21Q9UK80 565 aa22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.78■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 AFF2P51816 1311 aa22.77■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
USP18-201ENST00000215794 IL2RBP14784 551 aa22.76■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 G2E3Q7L622 706 aa22.76■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.75■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 PTPRCP08575 1304 aa22.75■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.75■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.75■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.74■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 GCC1Q96CN9 775 aa22.74■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 LGR6Q9HBX8 967 aa22.73■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa22.73■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.73■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 CYP27B1O15528 508 aa22.72■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.72■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.71■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 NECTIN2Q92692 538 aa22.71■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.71■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 F6X3S4 739 aa22.7■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 TBC1D32Q96NH3 1257 aa22.7■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 SPG7Q9UQ90 795 aa22.7■■□□□ 1.23
USP18-201ENST00000215794 ATP10DQ9P241 1426 aa22.7■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 MEIS3Q99687 375 aa22.7■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 DISP2A7MBM2 1401 aa22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 PHKG2P15735 406 aa22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 VPS72Q15906 364 aa22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 WNK3Q9BYP7 1800 aa22.69■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.67■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 STK31Q9BXU1 1019 aa22.66■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 A0A0G2JS52 829 aa22.66■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 CEP85Q6P2H3 762 aa22.66■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.66■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.66■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.65■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
USP18-201ENST00000215794 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.64■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.64■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.64■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 DCTPP1Q9H773 170 aa22.64■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 FLIIQ13045 1269 aa22.63■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 GLI3P10071 1580 aa22.63■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 BABAM1Q9NWV8 329 aa22.62■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
USP18-201ENST00000215794 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms