Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH7

Sema4g, Semaphorin-4G, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4gQ9WUH7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Sema4gQ9WUH7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sema4gQ9WUH7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Sema4gQ9WUH7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sema4gQ9WUH7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Sema4gQ9WUH7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Sema4gQ9WUH7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sema4gQ9WUH7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Sema4gQ9WUH7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Sema4gQ9WUH7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sema4gQ9WUH7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sema4gQ9WUH7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sema4gQ9WUH7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Sema4gQ9WUH7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sema4gQ9WUH7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Sema4gQ9WUH7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sema4gQ9WUH7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Sema4gQ9WUH7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sema4gQ9WUH7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Sema4gQ9WUH7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sema4gQ9WUH7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Sema4gQ9WUH7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Sema4gQ9WUH7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Sema4gQ9WUH7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Sema4gQ9WUH7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Sema4gQ9WUH7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Sema4gQ9WUH7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sema4gQ9WUH7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sema4gQ9WUH7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sema4gQ9WUH7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sema4gQ9WUH7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sema4gQ9WUH7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Sema4gQ9WUH7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sema4gQ9WUH7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sema4gQ9WUH7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sema4gQ9WUH7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sema4gQ9WUH7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Sema4gQ9WUH7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Sema4gQ9WUH7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Sema4gQ9WUH7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Sema4gQ9WUH7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Sema4gQ9WUH7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Sema4gQ9WUH7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sema4gQ9WUH7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sema4gQ9WUH7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sema4gQ9WUH7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Sema4gQ9WUH7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sema4gQ9WUH7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sema4gQ9WUH7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema4gQ9WUH7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sema4gQ9WUH7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Sema4gQ9WUH7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sema4gQ9WUH7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sema4gQ9WUH7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4gQ9WUH7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sema4gQ9WUH7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sema4gQ9WUH7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sema4gQ9WUH7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema4gQ9WUH7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sema4gQ9WUH7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sema4gQ9WUH7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sema4gQ9WUH7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sema4gQ9WUH7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sema4gQ9WUH7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sema4gQ9WUH7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sema4gQ9WUH7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sema4gQ9WUH7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sema4gQ9WUH7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sema4gQ9WUH7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sema4gQ9WUH7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sema4gQ9WUH7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sema4gQ9WUH7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sema4gQ9WUH7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema4gQ9WUH7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sema4gQ9WUH7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sema4gQ9WUH7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sema4gQ9WUH7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema4gQ9WUH7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sema4gQ9WUH7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sema4gQ9WUH7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sema4gQ9WUH7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sema4gQ9WUH7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema4gQ9WUH7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sema4gQ9WUH7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sema4gQ9WUH7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sema4gQ9WUH7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema4gQ9WUH7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sema4gQ9WUH7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sema4gQ9WUH7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sema4gQ9WUH7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema4gQ9WUH7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sema4gQ9WUH7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema4gQ9WUH7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sema4gQ9WUH7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sema4gQ9WUH7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sema4gQ9WUH7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sema4gQ9WUH7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema4gQ9WUH7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema4gQ9WUH7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Sema4gQ9WUH7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms