Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Ndrg3Q9QYF9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ndrg3Q9QYF9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ndrg3Q9QYF9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ndrg3Q9QYF9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ndrg3Q9QYF9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ndrg3Q9QYF9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ndrg3Q9QYF9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ndrg3Q9QYF9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ndrg3Q9QYF9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ndrg3Q9QYF9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ndrg3Q9QYF9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ndrg3Q9QYF9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ndrg3Q9QYF9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ndrg3Q9QYF9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ndrg3Q9QYF9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ndrg3Q9QYF9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ndrg3Q9QYF9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ndrg3Q9QYF9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndrg3Q9QYF9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ndrg3Q9QYF9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ndrg3Q9QYF9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ndrg3Q9QYF9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ndrg3Q9QYF9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndrg3Q9QYF9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ndrg3Q9QYF9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ndrg3Q9QYF9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ndrg3Q9QYF9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ndrg3Q9QYF9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndrg3Q9QYF9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndrg3Q9QYF9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ndrg3Q9QYF9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndrg3Q9QYF9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndrg3Q9QYF9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndrg3Q9QYF9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ndrg3Q9QYF9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ndrg3Q9QYF9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ndrg3Q9QYF9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ndrg3Q9QYF9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndrg3Q9QYF9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Ndrg3Q9QYF9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ndrg3Q9QYF9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ndrg3Q9QYF9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ndrg3Q9QYF9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ndrg3Q9QYF9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndrg3Q9QYF9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ndrg3Q9QYF9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ndrg3Q9QYF9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ndrg3Q9QYF9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ndrg3Q9QYF9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ndrg3Q9QYF9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ndrg3Q9QYF9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ndrg3Q9QYF9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ndrg3Q9QYF9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ndrg3Q9QYF9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ndrg3Q9QYF9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ndrg3Q9QYF9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ndrg3Q9QYF9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ndrg3Q9QYF9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ndrg3Q9QYF9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ndrg3Q9QYF9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ndrg3Q9QYF9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ndrg3Q9QYF9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ndrg3Q9QYF9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndrg3Q9QYF9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ndrg3Q9QYF9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ndrg3Q9QYF9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ndrg3Q9QYF9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndrg3Q9QYF9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ndrg3Q9QYF9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ndrg3Q9QYF9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndrg3Q9QYF9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndrg3Q9QYF9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ndrg3Q9QYF9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndrg3Q9QYF9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndrg3Q9QYF9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndrg3Q9QYF9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndrg3Q9QYF9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndrg3Q9QYF9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndrg3Q9QYF9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndrg3Q9QYF9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndrg3Q9QYF9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ndrg3Q9QYF9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndrg3Q9QYF9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ndrg3Q9QYF9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndrg3Q9QYF9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ndrg3Q9QYF9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ndrg3Q9QYF9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndrg3Q9QYF9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndrg3Q9QYF9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndrg3Q9QYF9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndrg3Q9QYF9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndrg3Q9QYF9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndrg3Q9QYF9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndrg3Q9QYF9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndrg3Q9QYF9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndrg3Q9QYF9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms