Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Pkp3Q9QY23 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pkp3Q9QY23 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pkp3Q9QY23 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Pkp3Q9QY23 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Pkp3Q9QY23 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Pkp3Q9QY23 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Pkp3Q9QY23 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Pkp3Q9QY23 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Pkp3Q9QY23 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pkp3Q9QY23 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pkp3Q9QY23 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
Pkp3Q9QY23 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Pkp3Q9QY23 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Pkp3Q9QY23 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Pkp3Q9QY23 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Pkp3Q9QY23 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Pkp3Q9QY23 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Pkp3Q9QY23 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pkp3Q9QY23 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pkp3Q9QY23 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pkp3Q9QY23 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pkp3Q9QY23 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Pkp3Q9QY23 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Pkp3Q9QY23 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Pkp3Q9QY23 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Pkp3Q9QY23 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Pkp3Q9QY23 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Pkp3Q9QY23 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Pkp3Q9QY23 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Pkp3Q9QY23 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pkp3Q9QY23 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Pkp3Q9QY23 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pkp3Q9QY23 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pkp3Q9QY23 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pkp3Q9QY23 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pkp3Q9QY23 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Pkp3Q9QY23 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pkp3Q9QY23 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pkp3Q9QY23 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pkp3Q9QY23 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pkp3Q9QY23 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pkp3Q9QY23 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pkp3Q9QY23 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pkp3Q9QY23 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pkp3Q9QY23 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pkp3Q9QY23 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pkp3Q9QY23 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pkp3Q9QY23 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pkp3Q9QY23 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pkp3Q9QY23 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pkp3Q9QY23 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pkp3Q9QY23 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pkp3Q9QY23 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkp3Q9QY23 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pkp3Q9QY23 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pkp3Q9QY23 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pkp3Q9QY23 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pkp3Q9QY23 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pkp3Q9QY23 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Pkp3Q9QY23 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pkp3Q9QY23 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pkp3Q9QY23 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pkp3Q9QY23 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pkp3Q9QY23 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pkp3Q9QY23 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pkp3Q9QY23 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pkp3Q9QY23 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkp3Q9QY23 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkp3Q9QY23 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pkp3Q9QY23 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pkp3Q9QY23 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pkp3Q9QY23 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pkp3Q9QY23 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Pkp3Q9QY23 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pkp3Q9QY23 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pkp3Q9QY23 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pkp3Q9QY23 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pkp3Q9QY23 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pkp3Q9QY23 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pkp3Q9QY23 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pkp3Q9QY23 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pkp3Q9QY23 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pkp3Q9QY23 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pkp3Q9QY23 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkp3Q9QY23 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pkp3Q9QY23 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pkp3Q9QY23 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Pkp3Q9QY23 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Pkp3Q9QY23 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Pkp3Q9QY23 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pkp3Q9QY23 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pkp3Q9QY23 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pkp3Q9QY23 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkp3Q9QY23 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkp3Q9QY23 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pkp3Q9QY23 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pkp3Q9QY23 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pkp3Q9QY23 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pkp3Q9QY23 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms