Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
Cpn1Q9JJN5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Cpn1Q9JJN5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Cpn1Q9JJN5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Cpn1Q9JJN5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Cpn1Q9JJN5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Cpn1Q9JJN5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Cpn1Q9JJN5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Cpn1Q9JJN5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cpn1Q9JJN5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cpn1Q9JJN5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cpn1Q9JJN5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cpn1Q9JJN5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpn1Q9JJN5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cpn1Q9JJN5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cpn1Q9JJN5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cpn1Q9JJN5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cpn1Q9JJN5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cpn1Q9JJN5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cpn1Q9JJN5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpn1Q9JJN5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cpn1Q9JJN5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cpn1Q9JJN5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cpn1Q9JJN5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpn1Q9JJN5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cpn1Q9JJN5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cpn1Q9JJN5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Cpn1Q9JJN5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Cpn1Q9JJN5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cpn1Q9JJN5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cpn1Q9JJN5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cpn1Q9JJN5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cpn1Q9JJN5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpn1Q9JJN5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cpn1Q9JJN5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cpn1Q9JJN5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpn1Q9JJN5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpn1Q9JJN5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cpn1Q9JJN5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cpn1Q9JJN5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cpn1Q9JJN5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cpn1Q9JJN5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cpn1Q9JJN5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cpn1Q9JJN5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cpn1Q9JJN5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cpn1Q9JJN5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cpn1Q9JJN5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cpn1Q9JJN5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cpn1Q9JJN5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Cpn1Q9JJN5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cpn1Q9JJN5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cpn1Q9JJN5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cpn1Q9JJN5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpn1Q9JJN5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cpn1Q9JJN5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpn1Q9JJN5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpn1Q9JJN5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpn1Q9JJN5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cpn1Q9JJN5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cpn1Q9JJN5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cpn1Q9JJN5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cpn1Q9JJN5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpn1Q9JJN5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpn1Q9JJN5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpn1Q9JJN5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpn1Q9JJN5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cpn1Q9JJN5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpn1Q9JJN5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpn1Q9JJN5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cpn1Q9JJN5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpn1Q9JJN5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpn1Q9JJN5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpn1Q9JJN5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpn1Q9JJN5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cpn1Q9JJN5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpn1Q9JJN5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpn1Q9JJN5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpn1Q9JJN5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpn1Q9JJN5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpn1Q9JJN5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpn1Q9JJN5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpn1Q9JJN5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cpn1Q9JJN5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpn1Q9JJN5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpn1Q9JJN5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpn1Q9JJN5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpn1Q9JJN5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpn1Q9JJN5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpn1Q9JJN5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpn1Q9JJN5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cpn1Q9JJN5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cpn1Q9JJN5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cpn1Q9JJN5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpn1Q9JJN5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cpn1Q9JJN5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cpn1Q9JJN5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cpn1Q9JJN5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cpn1Q9JJN5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cpn1Q9JJN5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cpn1Q9JJN5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms