Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET52

Cts6, Cathepsin-6, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts6Q9ET52 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Cts6Q9ET52 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cts6Q9ET52 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cts6Q9ET52 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Cts6Q9ET52 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Cts6Q9ET52 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Cts6Q9ET52 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Cts6Q9ET52 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Cts6Q9ET52 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Cts6Q9ET52 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Cts6Q9ET52 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Cts6Q9ET52 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Cts6Q9ET52 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Cts6Q9ET52 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Cts6Q9ET52 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Cts6Q9ET52 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Cts6Q9ET52 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Cts6Q9ET52 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Cts6Q9ET52 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Cts6Q9ET52 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Cts6Q9ET52 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cts6Q9ET52 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cts6Q9ET52 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cts6Q9ET52 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cts6Q9ET52 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Cts6Q9ET52 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cts6Q9ET52 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cts6Q9ET52 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cts6Q9ET52 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cts6Q9ET52 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Cts6Q9ET52 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cts6Q9ET52 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cts6Q9ET52 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cts6Q9ET52 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cts6Q9ET52 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cts6Q9ET52 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cts6Q9ET52 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cts6Q9ET52 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cts6Q9ET52 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cts6Q9ET52 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cts6Q9ET52 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cts6Q9ET52 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cts6Q9ET52 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Cts6Q9ET52 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cts6Q9ET52 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cts6Q9ET52 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cts6Q9ET52 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cts6Q9ET52 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cts6Q9ET52 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cts6Q9ET52 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cts6Q9ET52 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cts6Q9ET52 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cts6Q9ET52 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cts6Q9ET52 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cts6Q9ET52 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Cts6Q9ET52 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cts6Q9ET52 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cts6Q9ET52 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cts6Q9ET52 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cts6Q9ET52 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cts6Q9ET52 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cts6Q9ET52 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cts6Q9ET52 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cts6Q9ET52 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Cts6Q9ET52 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cts6Q9ET52 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cts6Q9ET52 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cts6Q9ET52 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cts6Q9ET52 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cts6Q9ET52 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cts6Q9ET52 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cts6Q9ET52 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cts6Q9ET52 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cts6Q9ET52 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cts6Q9ET52 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cts6Q9ET52 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Cts6Q9ET52 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cts6Q9ET52 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cts6Q9ET52 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cts6Q9ET52 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Cts6Q9ET52 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cts6Q9ET52 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Cts6Q9ET52 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cts6Q9ET52 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cts6Q9ET52 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cts6Q9ET52 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cts6Q9ET52 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cts6Q9ET52 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Cts6Q9ET52 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cts6Q9ET52 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cts6Q9ET52 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cts6Q9ET52 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cts6Q9ET52 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cts6Q9ET52 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cts6Q9ET52 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cts6Q9ET52 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cts6Q9ET52 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cts6Q9ET52 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cts6Q9ET52 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cts6Q9ET52 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms