Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
SgshQ9EQ08 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SgshQ9EQ08 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SgshQ9EQ08 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SgshQ9EQ08 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
SgshQ9EQ08 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SgshQ9EQ08 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SgshQ9EQ08 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SgshQ9EQ08 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SgshQ9EQ08 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SgshQ9EQ08 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SgshQ9EQ08 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
SgshQ9EQ08 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SgshQ9EQ08 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
SgshQ9EQ08 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
SgshQ9EQ08 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
SgshQ9EQ08 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
SgshQ9EQ08 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SgshQ9EQ08 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SgshQ9EQ08 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SgshQ9EQ08 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SgshQ9EQ08 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
SgshQ9EQ08 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SgshQ9EQ08 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
SgshQ9EQ08 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SgshQ9EQ08 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SgshQ9EQ08 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SgshQ9EQ08 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
SgshQ9EQ08 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SgshQ9EQ08 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SgshQ9EQ08 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SgshQ9EQ08 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SgshQ9EQ08 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SgshQ9EQ08 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SgshQ9EQ08 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SgshQ9EQ08 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SgshQ9EQ08 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SgshQ9EQ08 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SgshQ9EQ08 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SgshQ9EQ08 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SgshQ9EQ08 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SgshQ9EQ08 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SgshQ9EQ08 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SgshQ9EQ08 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SgshQ9EQ08 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SgshQ9EQ08 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SgshQ9EQ08 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SgshQ9EQ08 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SgshQ9EQ08 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SgshQ9EQ08 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SgshQ9EQ08 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SgshQ9EQ08 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
SgshQ9EQ08 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SgshQ9EQ08 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SgshQ9EQ08 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SgshQ9EQ08 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SgshQ9EQ08 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SgshQ9EQ08 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SgshQ9EQ08 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SgshQ9EQ08 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SgshQ9EQ08 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SgshQ9EQ08 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
SgshQ9EQ08 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SgshQ9EQ08 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SgshQ9EQ08 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SgshQ9EQ08 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SgshQ9EQ08 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SgshQ9EQ08 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SgshQ9EQ08 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SgshQ9EQ08 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SgshQ9EQ08 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SgshQ9EQ08 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SgshQ9EQ08 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SgshQ9EQ08 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SgshQ9EQ08 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SgshQ9EQ08 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SgshQ9EQ08 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SgshQ9EQ08 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SgshQ9EQ08 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SgshQ9EQ08 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
SgshQ9EQ08 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SgshQ9EQ08 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SgshQ9EQ08 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SgshQ9EQ08 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SgshQ9EQ08 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SgshQ9EQ08 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SgshQ9EQ08 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SgshQ9EQ08 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SgshQ9EQ08 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SgshQ9EQ08 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SgshQ9EQ08 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SgshQ9EQ08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SgshQ9EQ08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SgshQ9EQ08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SgshQ9EQ08 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SgshQ9EQ08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SgshQ9EQ08 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SgshQ9EQ08 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SgshQ9EQ08 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SgshQ9EQ08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms