Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Cnn3Q9DAW9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cnn3Q9DAW9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnn3Q9DAW9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cnn3Q9DAW9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cnn3Q9DAW9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cnn3Q9DAW9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cnn3Q9DAW9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cnn3Q9DAW9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cnn3Q9DAW9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnn3Q9DAW9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cnn3Q9DAW9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cnn3Q9DAW9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnn3Q9DAW9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnn3Q9DAW9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnn3Q9DAW9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cnn3Q9DAW9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cnn3Q9DAW9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cnn3Q9DAW9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cnn3Q9DAW9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cnn3Q9DAW9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cnn3Q9DAW9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cnn3Q9DAW9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnn3Q9DAW9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnn3Q9DAW9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnn3Q9DAW9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnn3Q9DAW9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cnn3Q9DAW9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnn3Q9DAW9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnn3Q9DAW9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnn3Q9DAW9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cnn3Q9DAW9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cnn3Q9DAW9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cnn3Q9DAW9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cnn3Q9DAW9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cnn3Q9DAW9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cnn3Q9DAW9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnn3Q9DAW9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnn3Q9DAW9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnn3Q9DAW9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cnn3Q9DAW9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cnn3Q9DAW9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cnn3Q9DAW9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cnn3Q9DAW9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cnn3Q9DAW9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cnn3Q9DAW9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cnn3Q9DAW9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cnn3Q9DAW9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnn3Q9DAW9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnn3Q9DAW9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnn3Q9DAW9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnn3Q9DAW9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnn3Q9DAW9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnn3Q9DAW9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnn3Q9DAW9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnn3Q9DAW9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnn3Q9DAW9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnn3Q9DAW9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnn3Q9DAW9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cnn3Q9DAW9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cnn3Q9DAW9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cnn3Q9DAW9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cnn3Q9DAW9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cnn3Q9DAW9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cnn3Q9DAW9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cnn3Q9DAW9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cnn3Q9DAW9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cnn3Q9DAW9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cnn3Q9DAW9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnn3Q9DAW9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cnn3Q9DAW9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnn3Q9DAW9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cnn3Q9DAW9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cnn3Q9DAW9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnn3Q9DAW9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cnn3Q9DAW9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnn3Q9DAW9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cnn3Q9DAW9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cnn3Q9DAW9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cnn3Q9DAW9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cnn3Q9DAW9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cnn3Q9DAW9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cnn3Q9DAW9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cnn3Q9DAW9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cnn3Q9DAW9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cnn3Q9DAW9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnn3Q9DAW9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cnn3Q9DAW9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cnn3Q9DAW9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cnn3Q9DAW9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnn3Q9DAW9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cnn3Q9DAW9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnn3Q9DAW9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnn3Q9DAW9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnn3Q9DAW9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnn3Q9DAW9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnn3Q9DAW9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnn3Q9DAW9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cnn3Q9DAW9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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