Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1mQ9DAD9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2al1mQ9DAD9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2al1mQ9DAD9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2al1mQ9DAD9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2al1mQ9DAD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2al1mQ9DAD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2al1mQ9DAD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al1mQ9DAD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al1mQ9DAD9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al1mQ9DAD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1mQ9DAD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al1mQ9DAD9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al1mQ9DAD9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al1mQ9DAD9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al1mQ9DAD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms