Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Rsph9Q9D9V4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Rsph9Q9D9V4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Rsph9Q9D9V4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Rsph9Q9D9V4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Rsph9Q9D9V4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rsph9Q9D9V4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Rsph9Q9D9V4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rsph9Q9D9V4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rsph9Q9D9V4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Rsph9Q9D9V4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Rsph9Q9D9V4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Rsph9Q9D9V4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Rsph9Q9D9V4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Rsph9Q9D9V4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph9Q9D9V4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rsph9Q9D9V4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Rsph9Q9D9V4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Rsph9Q9D9V4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rsph9Q9D9V4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Rsph9Q9D9V4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Rsph9Q9D9V4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rsph9Q9D9V4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Rsph9Q9D9V4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rsph9Q9D9V4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rsph9Q9D9V4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rsph9Q9D9V4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rsph9Q9D9V4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rsph9Q9D9V4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Rsph9Q9D9V4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Rsph9Q9D9V4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsph9Q9D9V4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Rsph9Q9D9V4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Rsph9Q9D9V4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Rsph9Q9D9V4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Rsph9Q9D9V4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rsph9Q9D9V4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rsph9Q9D9V4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rsph9Q9D9V4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsph9Q9D9V4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsph9Q9D9V4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsph9Q9D9V4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsph9Q9D9V4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rsph9Q9D9V4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rsph9Q9D9V4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rsph9Q9D9V4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Rsph9Q9D9V4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Rsph9Q9D9V4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rsph9Q9D9V4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rsph9Q9D9V4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rsph9Q9D9V4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rsph9Q9D9V4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsph9Q9D9V4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsph9Q9D9V4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rsph9Q9D9V4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph9Q9D9V4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph9Q9D9V4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph9Q9D9V4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rsph9Q9D9V4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph9Q9D9V4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph9Q9D9V4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph9Q9D9V4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph9Q9D9V4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph9Q9D9V4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rsph9Q9D9V4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rsph9Q9D9V4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rsph9Q9D9V4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rsph9Q9D9V4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rsph9Q9D9V4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph9Q9D9V4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rsph9Q9D9V4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rsph9Q9D9V4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rsph9Q9D9V4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph9Q9D9V4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Rsph9Q9D9V4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph9Q9D9V4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Rsph9Q9D9V4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Rsph9Q9D9V4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph9Q9D9V4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph9Q9D9V4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rsph9Q9D9V4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsph9Q9D9V4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph9Q9D9V4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsph9Q9D9V4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsph9Q9D9V4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsph9Q9D9V4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph9Q9D9V4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.51■■■□□ 2
Rsph9Q9D9V4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph9Q9D9V4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rsph9Q9D9V4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rsph9Q9D9V4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rsph9Q9D9V4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rsph9Q9D9V4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms