Protein–RNA interactions for Protein: Q9D799

Mtfmt, Methionyl-tRNA formyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtfmtQ9D799 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
MtfmtQ9D799 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MtfmtQ9D799 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
MtfmtQ9D799 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MtfmtQ9D799 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MtfmtQ9D799 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MtfmtQ9D799 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MtfmtQ9D799 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MtfmtQ9D799 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MtfmtQ9D799 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MtfmtQ9D799 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MtfmtQ9D799 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MtfmtQ9D799 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MtfmtQ9D799 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MtfmtQ9D799 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MtfmtQ9D799 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MtfmtQ9D799 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MtfmtQ9D799 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MtfmtQ9D799 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MtfmtQ9D799 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MtfmtQ9D799 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MtfmtQ9D799 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MtfmtQ9D799 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MtfmtQ9D799 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MtfmtQ9D799 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MtfmtQ9D799 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MtfmtQ9D799 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MtfmtQ9D799 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MtfmtQ9D799 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MtfmtQ9D799 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MtfmtQ9D799 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MtfmtQ9D799 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MtfmtQ9D799 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MtfmtQ9D799 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MtfmtQ9D799 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MtfmtQ9D799 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MtfmtQ9D799 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MtfmtQ9D799 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MtfmtQ9D799 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MtfmtQ9D799 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MtfmtQ9D799 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MtfmtQ9D799 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MtfmtQ9D799 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MtfmtQ9D799 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MtfmtQ9D799 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MtfmtQ9D799 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MtfmtQ9D799 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MtfmtQ9D799 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MtfmtQ9D799 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MtfmtQ9D799 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MtfmtQ9D799 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MtfmtQ9D799 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MtfmtQ9D799 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MtfmtQ9D799 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MtfmtQ9D799 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MtfmtQ9D799 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MtfmtQ9D799 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MtfmtQ9D799 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtfmtQ9D799 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtfmtQ9D799 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MtfmtQ9D799 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MtfmtQ9D799 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MtfmtQ9D799 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MtfmtQ9D799 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MtfmtQ9D799 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MtfmtQ9D799 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtfmtQ9D799 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MtfmtQ9D799 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MtfmtQ9D799 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MtfmtQ9D799 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MtfmtQ9D799 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MtfmtQ9D799 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MtfmtQ9D799 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MtfmtQ9D799 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MtfmtQ9D799 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MtfmtQ9D799 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MtfmtQ9D799 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MtfmtQ9D799 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MtfmtQ9D799 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MtfmtQ9D799 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MtfmtQ9D799 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MtfmtQ9D799 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtfmtQ9D799 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtfmtQ9D799 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MtfmtQ9D799 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MtfmtQ9D799 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MtfmtQ9D799 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtfmtQ9D799 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtfmtQ9D799 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtfmtQ9D799 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtfmtQ9D799 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtfmtQ9D799 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtfmtQ9D799 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms