Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
PirQ9D711 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PirQ9D711 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PirQ9D711 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PirQ9D711 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
PirQ9D711 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PirQ9D711 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PirQ9D711 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PirQ9D711 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
PirQ9D711 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PirQ9D711 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
PirQ9D711 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PirQ9D711 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PirQ9D711 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PirQ9D711 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PirQ9D711 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PirQ9D711 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
PirQ9D711 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PirQ9D711 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PirQ9D711 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PirQ9D711 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PirQ9D711 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PirQ9D711 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PirQ9D711 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PirQ9D711 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PirQ9D711 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PirQ9D711 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PirQ9D711 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
PirQ9D711 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PirQ9D711 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PirQ9D711 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PirQ9D711 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PirQ9D711 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PirQ9D711 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PirQ9D711 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PirQ9D711 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PirQ9D711 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PirQ9D711 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PirQ9D711 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
PirQ9D711 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PirQ9D711 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
PirQ9D711 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PirQ9D711 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PirQ9D711 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PirQ9D711 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PirQ9D711 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PirQ9D711 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PirQ9D711 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PirQ9D711 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PirQ9D711 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PirQ9D711 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PirQ9D711 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PirQ9D711 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PirQ9D711 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
PirQ9D711 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PirQ9D711 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PirQ9D711 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PirQ9D711 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PirQ9D711 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
PirQ9D711 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PirQ9D711 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PirQ9D711 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PirQ9D711 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PirQ9D711 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PirQ9D711 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PirQ9D711 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PirQ9D711 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PirQ9D711 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PirQ9D711 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PirQ9D711 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PirQ9D711 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PirQ9D711 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PirQ9D711 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PirQ9D711 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PirQ9D711 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PirQ9D711 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PirQ9D711 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PirQ9D711 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PirQ9D711 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PirQ9D711 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
PirQ9D711 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PirQ9D711 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PirQ9D711 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
PirQ9D711 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
PirQ9D711 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
PirQ9D711 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PirQ9D711 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PirQ9D711 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PirQ9D711 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PirQ9D711 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PirQ9D711 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PirQ9D711 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PirQ9D711 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
PirQ9D711 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PirQ9D711 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PirQ9D711 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PirQ9D711 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PirQ9D711 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PirQ9D711 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PirQ9D711 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms