Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW73

B3gat1, Galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gat1Q9CW73 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
B3gat1Q9CW73 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
B3gat1Q9CW73 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
B3gat1Q9CW73 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
B3gat1Q9CW73 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
B3gat1Q9CW73 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
B3gat1Q9CW73 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
B3gat1Q9CW73 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
B3gat1Q9CW73 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
B3gat1Q9CW73 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
B3gat1Q9CW73 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
B3gat1Q9CW73 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
B3gat1Q9CW73 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
B3gat1Q9CW73 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
B3gat1Q9CW73 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
B3gat1Q9CW73 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
B3gat1Q9CW73 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
B3gat1Q9CW73 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
B3gat1Q9CW73 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
B3gat1Q9CW73 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
B3gat1Q9CW73 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
B3gat1Q9CW73 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
B3gat1Q9CW73 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
B3gat1Q9CW73 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
B3gat1Q9CW73 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
B3gat1Q9CW73 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
B3gat1Q9CW73 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
B3gat1Q9CW73 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
B3gat1Q9CW73 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
B3gat1Q9CW73 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
B3gat1Q9CW73 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
B3gat1Q9CW73 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
B3gat1Q9CW73 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
B3gat1Q9CW73 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
B3gat1Q9CW73 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
B3gat1Q9CW73 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
B3gat1Q9CW73 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
B3gat1Q9CW73 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
B3gat1Q9CW73 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
B3gat1Q9CW73 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
B3gat1Q9CW73 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
B3gat1Q9CW73 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
B3gat1Q9CW73 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
B3gat1Q9CW73 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
B3gat1Q9CW73 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
B3gat1Q9CW73 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
B3gat1Q9CW73 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
B3gat1Q9CW73 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
B3gat1Q9CW73 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
B3gat1Q9CW73 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B3gat1Q9CW73 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B3gat1Q9CW73 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
B3gat1Q9CW73 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B3gat1Q9CW73 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
B3gat1Q9CW73 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
B3gat1Q9CW73 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
B3gat1Q9CW73 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
B3gat1Q9CW73 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
B3gat1Q9CW73 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B3gat1Q9CW73 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
B3gat1Q9CW73 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
B3gat1Q9CW73 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
B3gat1Q9CW73 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
B3gat1Q9CW73 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
B3gat1Q9CW73 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
B3gat1Q9CW73 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
B3gat1Q9CW73 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
B3gat1Q9CW73 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
B3gat1Q9CW73 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
B3gat1Q9CW73 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
B3gat1Q9CW73 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
B3gat1Q9CW73 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
B3gat1Q9CW73 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
B3gat1Q9CW73 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
B3gat1Q9CW73 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
B3gat1Q9CW73 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
B3gat1Q9CW73 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
B3gat1Q9CW73 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
B3gat1Q9CW73 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
B3gat1Q9CW73 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
B3gat1Q9CW73 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
B3gat1Q9CW73 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
B3gat1Q9CW73 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
B3gat1Q9CW73 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
B3gat1Q9CW73 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
B3gat1Q9CW73 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B3gat1Q9CW73 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
B3gat1Q9CW73 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
B3gat1Q9CW73 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
B3gat1Q9CW73 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
B3gat1Q9CW73 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
B3gat1Q9CW73 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
B3gat1Q9CW73 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
B3gat1Q9CW73 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
B3gat1Q9CW73 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
B3gat1Q9CW73 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
B3gat1Q9CW73 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
B3gat1Q9CW73 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B3gat1Q9CW73 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B3gat1Q9CW73 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.2 ms