Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW7

Zmat2, Zinc finger matrin-type protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat2Q9CPW7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41■■■■■ 4.15
Zmat2Q9CPW7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Zmat2Q9CPW7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Zmat2Q9CPW7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Zmat2Q9CPW7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Zmat2Q9CPW7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Zmat2Q9CPW7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Zmat2Q9CPW7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Zmat2Q9CPW7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Zmat2Q9CPW7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Zmat2Q9CPW7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Zmat2Q9CPW7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Zmat2Q9CPW7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Zmat2Q9CPW7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Zmat2Q9CPW7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Zmat2Q9CPW7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Zmat2Q9CPW7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Zmat2Q9CPW7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Zmat2Q9CPW7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Zmat2Q9CPW7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Zmat2Q9CPW7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Zmat2Q9CPW7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Zmat2Q9CPW7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Zmat2Q9CPW7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Zmat2Q9CPW7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Zmat2Q9CPW7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Zmat2Q9CPW7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Zmat2Q9CPW7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Zmat2Q9CPW7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Zmat2Q9CPW7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Zmat2Q9CPW7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Zmat2Q9CPW7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Zmat2Q9CPW7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Zmat2Q9CPW7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Zmat2Q9CPW7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Zmat2Q9CPW7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Zmat2Q9CPW7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Zmat2Q9CPW7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Zmat2Q9CPW7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Zmat2Q9CPW7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Zmat2Q9CPW7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Zmat2Q9CPW7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Zmat2Q9CPW7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Zmat2Q9CPW7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Zmat2Q9CPW7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Zmat2Q9CPW7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Zmat2Q9CPW7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Zmat2Q9CPW7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Zmat2Q9CPW7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Zmat2Q9CPW7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Zmat2Q9CPW7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Zmat2Q9CPW7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Zmat2Q9CPW7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Zmat2Q9CPW7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Zmat2Q9CPW7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Zmat2Q9CPW7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Zmat2Q9CPW7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Zmat2Q9CPW7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Zmat2Q9CPW7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Zmat2Q9CPW7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Zmat2Q9CPW7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Zmat2Q9CPW7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Zmat2Q9CPW7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Zmat2Q9CPW7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Zmat2Q9CPW7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Zmat2Q9CPW7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Zmat2Q9CPW7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Zmat2Q9CPW7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Zmat2Q9CPW7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Zmat2Q9CPW7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Zmat2Q9CPW7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Zmat2Q9CPW7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Zmat2Q9CPW7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Zmat2Q9CPW7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Zmat2Q9CPW7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Zmat2Q9CPW7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Zmat2Q9CPW7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Zmat2Q9CPW7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Zmat2Q9CPW7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Zmat2Q9CPW7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Zmat2Q9CPW7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Zmat2Q9CPW7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Zmat2Q9CPW7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zmat2Q9CPW7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Zmat2Q9CPW7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Zmat2Q9CPW7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Zmat2Q9CPW7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zmat2Q9CPW7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Zmat2Q9CPW7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zmat2Q9CPW7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zmat2Q9CPW7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Zmat2Q9CPW7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zmat2Q9CPW7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Zmat2Q9CPW7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
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