Protein–RNA interactions for Protein: Q99N10

Ms4a8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, mousemouse

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a8Q99N10 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Ms4a8Q99N10 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ms4a8Q99N10 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ms4a8Q99N10 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Ms4a8Q99N10 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ms4a8Q99N10 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ms4a8Q99N10 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a8Q99N10 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ms4a8Q99N10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ms4a8Q99N10 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ms4a8Q99N10 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ms4a8Q99N10 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ms4a8Q99N10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ms4a8Q99N10 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ms4a8Q99N10 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ms4a8Q99N10 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ms4a8Q99N10 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ms4a8Q99N10 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ms4a8Q99N10 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ms4a8Q99N10 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ms4a8Q99N10 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ms4a8Q99N10 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ms4a8Q99N10 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a8Q99N10 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ms4a8Q99N10 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ms4a8Q99N10 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ms4a8Q99N10 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ms4a8Q99N10 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ms4a8Q99N10 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a8Q99N10 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a8Q99N10 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ms4a8Q99N10 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ms4a8Q99N10 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ms4a8Q99N10 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ms4a8Q99N10 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ms4a8Q99N10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ms4a8Q99N10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ms4a8Q99N10 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ms4a8Q99N10 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a8Q99N10 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ms4a8Q99N10 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ms4a8Q99N10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ms4a8Q99N10 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ms4a8Q99N10 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ms4a8Q99N10 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a8Q99N10 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ms4a8Q99N10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a8Q99N10 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a8Q99N10 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a8Q99N10 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a8Q99N10 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a8Q99N10 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ms4a8Q99N10 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ms4a8Q99N10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ms4a8Q99N10 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ms4a8Q99N10 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ms4a8Q99N10 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ms4a8Q99N10 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ms4a8Q99N10 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ms4a8Q99N10 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ms4a8Q99N10 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ms4a8Q99N10 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ms4a8Q99N10 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ms4a8Q99N10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ms4a8Q99N10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ms4a8Q99N10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ms4a8Q99N10 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ms4a8Q99N10 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ms4a8Q99N10 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ms4a8Q99N10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ms4a8Q99N10 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ms4a8Q99N10 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ms4a8Q99N10 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ms4a8Q99N10 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ms4a8Q99N10 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ms4a8Q99N10 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ms4a8Q99N10 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ms4a8Q99N10 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a8Q99N10 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a8Q99N10 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a8Q99N10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a8Q99N10 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a8Q99N10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a8Q99N10 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a8Q99N10 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ms4a8Q99N10 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a8Q99N10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a8Q99N10 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a8Q99N10 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a8Q99N10 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ms4a8Q99N10 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ms4a8Q99N10 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ms4a8Q99N10 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ms4a8Q99N10 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ms4a8Q99N10 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ms4a8Q99N10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a8Q99N10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a8Q99N10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a8Q99N10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a8Q99N10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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