Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Rab28Q99KL7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rab28Q99KL7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Rab28Q99KL7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rab28Q99KL7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Rab28Q99KL7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rab28Q99KL7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Rab28Q99KL7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Rab28Q99KL7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Rab28Q99KL7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Rab28Q99KL7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Rab28Q99KL7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rab28Q99KL7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rab28Q99KL7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rab28Q99KL7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rab28Q99KL7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
Rab28Q99KL7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rab28Q99KL7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rab28Q99KL7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rab28Q99KL7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rab28Q99KL7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rab28Q99KL7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Rab28Q99KL7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rab28Q99KL7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rab28Q99KL7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rab28Q99KL7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rab28Q99KL7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Rab28Q99KL7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Rab28Q99KL7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rab28Q99KL7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rab28Q99KL7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Rab28Q99KL7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rab28Q99KL7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rab28Q99KL7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rab28Q99KL7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rab28Q99KL7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab28Q99KL7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rab28Q99KL7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rab28Q99KL7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rab28Q99KL7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rab28Q99KL7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rab28Q99KL7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rab28Q99KL7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Rab28Q99KL7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab28Q99KL7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rab28Q99KL7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rab28Q99KL7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rab28Q99KL7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rab28Q99KL7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rab28Q99KL7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rab28Q99KL7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rab28Q99KL7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rab28Q99KL7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rab28Q99KL7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rab28Q99KL7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab28Q99KL7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rab28Q99KL7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rab28Q99KL7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rab28Q99KL7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rab28Q99KL7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rab28Q99KL7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rab28Q99KL7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rab28Q99KL7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rab28Q99KL7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab28Q99KL7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rab28Q99KL7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rab28Q99KL7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rab28Q99KL7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rab28Q99KL7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rab28Q99KL7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab28Q99KL7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rab28Q99KL7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rab28Q99KL7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab28Q99KL7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rab28Q99KL7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rab28Q99KL7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rab28Q99KL7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rab28Q99KL7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rab28Q99KL7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rab28Q99KL7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab28Q99KL7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Rab28Q99KL7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rab28Q99KL7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rab28Q99KL7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rab28Q99KL7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rab28Q99KL7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rab28Q99KL7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab28Q99KL7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab28Q99KL7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rab28Q99KL7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rab28Q99KL7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rab28Q99KL7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rab28Q99KL7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rab28Q99KL7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rab28Q99KL7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rab28Q99KL7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rab28Q99KL7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rab28Q99KL7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rab28Q99KL7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rab28Q99KL7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms