Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
Slc8b1Q925Q3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Slc8b1Q925Q3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Slc8b1Q925Q3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Slc8b1Q925Q3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Slc8b1Q925Q3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Slc8b1Q925Q3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Slc8b1Q925Q3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Slc8b1Q925Q3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Slc8b1Q925Q3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Slc8b1Q925Q3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Slc8b1Q925Q3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc8b1Q925Q3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Slc8b1Q925Q3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slc8b1Q925Q3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Slc8b1Q925Q3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Slc8b1Q925Q3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Slc8b1Q925Q3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slc8b1Q925Q3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Slc8b1Q925Q3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Slc8b1Q925Q3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Slc8b1Q925Q3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc8b1Q925Q3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Slc8b1Q925Q3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Slc8b1Q925Q3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc8b1Q925Q3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc8b1Q925Q3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc8b1Q925Q3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc8b1Q925Q3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc8b1Q925Q3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc8b1Q925Q3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Slc8b1Q925Q3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Slc8b1Q925Q3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc8b1Q925Q3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slc8b1Q925Q3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Slc8b1Q925Q3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slc8b1Q925Q3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Slc8b1Q925Q3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Slc8b1Q925Q3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Slc8b1Q925Q3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc8b1Q925Q3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Slc8b1Q925Q3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Slc8b1Q925Q3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Slc8b1Q925Q3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Slc8b1Q925Q3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Slc8b1Q925Q3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Slc8b1Q925Q3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Slc8b1Q925Q3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Slc8b1Q925Q3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc8b1Q925Q3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Slc8b1Q925Q3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Slc8b1Q925Q3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Slc8b1Q925Q3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Slc8b1Q925Q3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Slc8b1Q925Q3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Slc8b1Q925Q3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Slc8b1Q925Q3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Slc8b1Q925Q3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Slc8b1Q925Q3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Slc8b1Q925Q3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Slc8b1Q925Q3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Slc8b1Q925Q3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Slc8b1Q925Q3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Slc8b1Q925Q3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Slc8b1Q925Q3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Slc8b1Q925Q3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Slc8b1Q925Q3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Slc8b1Q925Q3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Slc8b1Q925Q3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc8b1Q925Q3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Slc8b1Q925Q3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc8b1Q925Q3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Slc8b1Q925Q3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Slc8b1Q925Q3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Slc8b1Q925Q3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Slc8b1Q925Q3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slc8b1Q925Q3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Slc8b1Q925Q3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Slc8b1Q925Q3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Slc8b1Q925Q3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Slc8b1Q925Q3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Slc8b1Q925Q3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc8b1Q925Q3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Slc8b1Q925Q3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc8b1Q925Q3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Slc8b1Q925Q3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Slc8b1Q925Q3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slc8b1Q925Q3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slc8b1Q925Q3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slc8b1Q925Q3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc8b1Q925Q3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Slc8b1Q925Q3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Slc8b1Q925Q3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc8b1Q925Q3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Slc8b1Q925Q3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc8b1Q925Q3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc8b1Q925Q3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc8b1Q925Q3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc8b1Q925Q3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms