Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Treml1Q8K558 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Treml1Q8K558 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Treml1Q8K558 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Treml1Q8K558 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Treml1Q8K558 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Treml1Q8K558 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Treml1Q8K558 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Treml1Q8K558 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Treml1Q8K558 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Treml1Q8K558 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Treml1Q8K558 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Treml1Q8K558 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Treml1Q8K558 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Treml1Q8K558 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Treml1Q8K558 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Treml1Q8K558 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Treml1Q8K558 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Treml1Q8K558 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Treml1Q8K558 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Treml1Q8K558 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Treml1Q8K558 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Treml1Q8K558 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Treml1Q8K558 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Treml1Q8K558 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Treml1Q8K558 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Treml1Q8K558 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Treml1Q8K558 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Treml1Q8K558 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Treml1Q8K558 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Treml1Q8K558 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Treml1Q8K558 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Treml1Q8K558 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Treml1Q8K558 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Treml1Q8K558 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Treml1Q8K558 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Treml1Q8K558 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Treml1Q8K558 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Treml1Q8K558 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Treml1Q8K558 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Treml1Q8K558 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Treml1Q8K558 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Treml1Q8K558 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Treml1Q8K558 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Treml1Q8K558 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Treml1Q8K558 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Treml1Q8K558 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Treml1Q8K558 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Treml1Q8K558 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Treml1Q8K558 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Treml1Q8K558 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Treml1Q8K558 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Treml1Q8K558 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Treml1Q8K558 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Treml1Q8K558 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Treml1Q8K558 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Treml1Q8K558 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Treml1Q8K558 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Treml1Q8K558 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Treml1Q8K558 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Treml1Q8K558 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Treml1Q8K558 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Treml1Q8K558 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Treml1Q8K558 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Treml1Q8K558 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Treml1Q8K558 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Treml1Q8K558 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Treml1Q8K558 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Treml1Q8K558 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Treml1Q8K558 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Treml1Q8K558 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Treml1Q8K558 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Treml1Q8K558 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Treml1Q8K558 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Treml1Q8K558 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Treml1Q8K558 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Treml1Q8K558 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Treml1Q8K558 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Treml1Q8K558 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Treml1Q8K558 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Treml1Q8K558 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Treml1Q8K558 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Treml1Q8K558 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Treml1Q8K558 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Treml1Q8K558 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Treml1Q8K558 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Treml1Q8K558 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Treml1Q8K558 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Treml1Q8K558 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Treml1Q8K558 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Treml1Q8K558 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Treml1Q8K558 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Treml1Q8K558 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Treml1Q8K558 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Treml1Q8K558 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Treml1Q8K558 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Treml1Q8K558 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Treml1Q8K558 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Treml1Q8K558 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Treml1Q8K558 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.7 ms