Protein–RNA interactions for Protein: Q8K354

Cbr3, Carbonyl reductase [NADPH] 3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbr3Q8K354 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Cbr3Q8K354 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Cbr3Q8K354 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Cbr3Q8K354 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Cbr3Q8K354 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Cbr3Q8K354 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Cbr3Q8K354 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Cbr3Q8K354 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Cbr3Q8K354 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Cbr3Q8K354 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cbr3Q8K354 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cbr3Q8K354 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cbr3Q8K354 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cbr3Q8K354 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cbr3Q8K354 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cbr3Q8K354 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cbr3Q8K354 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Cbr3Q8K354 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cbr3Q8K354 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cbr3Q8K354 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cbr3Q8K354 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cbr3Q8K354 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Cbr3Q8K354 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cbr3Q8K354 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cbr3Q8K354 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cbr3Q8K354 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cbr3Q8K354 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cbr3Q8K354 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cbr3Q8K354 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cbr3Q8K354 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cbr3Q8K354 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cbr3Q8K354 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cbr3Q8K354 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cbr3Q8K354 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cbr3Q8K354 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cbr3Q8K354 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cbr3Q8K354 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cbr3Q8K354 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cbr3Q8K354 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Cbr3Q8K354 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cbr3Q8K354 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cbr3Q8K354 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cbr3Q8K354 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cbr3Q8K354 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cbr3Q8K354 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cbr3Q8K354 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cbr3Q8K354 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cbr3Q8K354 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbr3Q8K354 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cbr3Q8K354 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cbr3Q8K354 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cbr3Q8K354 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cbr3Q8K354 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Cbr3Q8K354 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cbr3Q8K354 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cbr3Q8K354 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cbr3Q8K354 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cbr3Q8K354 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbr3Q8K354 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cbr3Q8K354 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cbr3Q8K354 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cbr3Q8K354 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cbr3Q8K354 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cbr3Q8K354 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cbr3Q8K354 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cbr3Q8K354 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cbr3Q8K354 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cbr3Q8K354 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cbr3Q8K354 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cbr3Q8K354 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cbr3Q8K354 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cbr3Q8K354 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cbr3Q8K354 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cbr3Q8K354 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cbr3Q8K354 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cbr3Q8K354 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cbr3Q8K354 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cbr3Q8K354 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Cbr3Q8K354 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cbr3Q8K354 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cbr3Q8K354 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cbr3Q8K354 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cbr3Q8K354 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbr3Q8K354 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cbr3Q8K354 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cbr3Q8K354 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cbr3Q8K354 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cbr3Q8K354 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cbr3Q8K354 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cbr3Q8K354 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbr3Q8K354 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cbr3Q8K354 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cbr3Q8K354 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cbr3Q8K354 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cbr3Q8K354 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cbr3Q8K354 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbr3Q8K354 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cbr3Q8K354 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cbr3Q8K354 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cbr3Q8K354 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms