Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Ccm2Q8K2Y9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Ccm2Q8K2Y9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ccm2Q8K2Y9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Ccm2Q8K2Y9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ccm2Q8K2Y9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Ccm2Q8K2Y9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ccm2Q8K2Y9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Ccm2Q8K2Y9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Ccm2Q8K2Y9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ccm2Q8K2Y9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccm2Q8K2Y9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccm2Q8K2Y9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ccm2Q8K2Y9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ccm2Q8K2Y9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccm2Q8K2Y9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ccm2Q8K2Y9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccm2Q8K2Y9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccm2Q8K2Y9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccm2Q8K2Y9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccm2Q8K2Y9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccm2Q8K2Y9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccm2Q8K2Y9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccm2Q8K2Y9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccm2Q8K2Y9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccm2Q8K2Y9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccm2Q8K2Y9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccm2Q8K2Y9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccm2Q8K2Y9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ccm2Q8K2Y9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ccm2Q8K2Y9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccm2Q8K2Y9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccm2Q8K2Y9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccm2Q8K2Y9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccm2Q8K2Y9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccm2Q8K2Y9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccm2Q8K2Y9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccm2Q8K2Y9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccm2Q8K2Y9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccm2Q8K2Y9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccm2Q8K2Y9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccm2Q8K2Y9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccm2Q8K2Y9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccm2Q8K2Y9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccm2Q8K2Y9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccm2Q8K2Y9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccm2Q8K2Y9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccm2Q8K2Y9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccm2Q8K2Y9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccm2Q8K2Y9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccm2Q8K2Y9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccm2Q8K2Y9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccm2Q8K2Y9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccm2Q8K2Y9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccm2Q8K2Y9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccm2Q8K2Y9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccm2Q8K2Y9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccm2Q8K2Y9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccm2Q8K2Y9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccm2Q8K2Y9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccm2Q8K2Y9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccm2Q8K2Y9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccm2Q8K2Y9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccm2Q8K2Y9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccm2Q8K2Y9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccm2Q8K2Y9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccm2Q8K2Y9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccm2Q8K2Y9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccm2Q8K2Y9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccm2Q8K2Y9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccm2Q8K2Y9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccm2Q8K2Y9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccm2Q8K2Y9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccm2Q8K2Y9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Ccm2Q8K2Y9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccm2Q8K2Y9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccm2Q8K2Y9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccm2Q8K2Y9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccm2Q8K2Y9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccm2Q8K2Y9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ccm2Q8K2Y9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccm2Q8K2Y9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccm2Q8K2Y9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ccm2Q8K2Y9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccm2Q8K2Y9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccm2Q8K2Y9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccm2Q8K2Y9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms