Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIF4

Btd, Biotinidase, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtdQ8CIF4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
BtdQ8CIF4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BtdQ8CIF4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BtdQ8CIF4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
BtdQ8CIF4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
BtdQ8CIF4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
BtdQ8CIF4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
BtdQ8CIF4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
BtdQ8CIF4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
BtdQ8CIF4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BtdQ8CIF4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
BtdQ8CIF4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
BtdQ8CIF4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
BtdQ8CIF4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
BtdQ8CIF4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BtdQ8CIF4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BtdQ8CIF4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
BtdQ8CIF4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BtdQ8CIF4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BtdQ8CIF4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BtdQ8CIF4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
BtdQ8CIF4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BtdQ8CIF4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
BtdQ8CIF4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BtdQ8CIF4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BtdQ8CIF4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BtdQ8CIF4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BtdQ8CIF4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
BtdQ8CIF4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BtdQ8CIF4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BtdQ8CIF4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BtdQ8CIF4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BtdQ8CIF4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BtdQ8CIF4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BtdQ8CIF4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BtdQ8CIF4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BtdQ8CIF4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BtdQ8CIF4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BtdQ8CIF4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BtdQ8CIF4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BtdQ8CIF4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BtdQ8CIF4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BtdQ8CIF4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BtdQ8CIF4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BtdQ8CIF4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BtdQ8CIF4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BtdQ8CIF4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BtdQ8CIF4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BtdQ8CIF4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BtdQ8CIF4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BtdQ8CIF4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BtdQ8CIF4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BtdQ8CIF4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BtdQ8CIF4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BtdQ8CIF4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BtdQ8CIF4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BtdQ8CIF4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BtdQ8CIF4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BtdQ8CIF4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BtdQ8CIF4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BtdQ8CIF4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BtdQ8CIF4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
BtdQ8CIF4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BtdQ8CIF4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BtdQ8CIF4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BtdQ8CIF4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BtdQ8CIF4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BtdQ8CIF4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
BtdQ8CIF4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BtdQ8CIF4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
BtdQ8CIF4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BtdQ8CIF4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BtdQ8CIF4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BtdQ8CIF4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BtdQ8CIF4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BtdQ8CIF4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BtdQ8CIF4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BtdQ8CIF4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BtdQ8CIF4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BtdQ8CIF4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BtdQ8CIF4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BtdQ8CIF4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
BtdQ8CIF4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
BtdQ8CIF4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BtdQ8CIF4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BtdQ8CIF4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BtdQ8CIF4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BtdQ8CIF4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BtdQ8CIF4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BtdQ8CIF4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BtdQ8CIF4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
BtdQ8CIF4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BtdQ8CIF4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BtdQ8CIF4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BtdQ8CIF4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
BtdQ8CIF4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BtdQ8CIF4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BtdQ8CIF4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BtdQ8CIF4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BtdQ8CIF4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 196.5 ms