Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE2

Zmiz2, Zinc finger MIZ domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmiz2Q8CIE2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Zmiz2Q8CIE2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Zmiz2Q8CIE2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Zmiz2Q8CIE2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Zmiz2Q8CIE2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Zmiz2Q8CIE2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Zmiz2Q8CIE2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Zmiz2Q8CIE2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Zmiz2Q8CIE2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Zmiz2Q8CIE2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Zmiz2Q8CIE2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Zmiz2Q8CIE2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Zmiz2Q8CIE2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Zmiz2Q8CIE2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Zmiz2Q8CIE2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Zmiz2Q8CIE2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Zmiz2Q8CIE2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Zmiz2Q8CIE2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Zmiz2Q8CIE2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Zmiz2Q8CIE2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Zmiz2Q8CIE2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Zmiz2Q8CIE2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Zmiz2Q8CIE2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Zmiz2Q8CIE2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Zmiz2Q8CIE2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Zmiz2Q8CIE2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Zmiz2Q8CIE2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Zmiz2Q8CIE2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Zmiz2Q8CIE2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Zmiz2Q8CIE2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Zmiz2Q8CIE2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Zmiz2Q8CIE2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Zmiz2Q8CIE2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Zmiz2Q8CIE2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Zmiz2Q8CIE2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Zmiz2Q8CIE2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Zmiz2Q8CIE2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Zmiz2Q8CIE2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Zmiz2Q8CIE2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Zmiz2Q8CIE2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Zmiz2Q8CIE2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Zmiz2Q8CIE2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Zmiz2Q8CIE2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Zmiz2Q8CIE2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Zmiz2Q8CIE2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Zmiz2Q8CIE2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Zmiz2Q8CIE2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Zmiz2Q8CIE2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Zmiz2Q8CIE2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Zmiz2Q8CIE2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Zmiz2Q8CIE2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Zmiz2Q8CIE2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Zmiz2Q8CIE2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Zmiz2Q8CIE2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Zmiz2Q8CIE2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Zmiz2Q8CIE2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Zmiz2Q8CIE2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Zmiz2Q8CIE2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Zmiz2Q8CIE2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zmiz2Q8CIE2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Zmiz2Q8CIE2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Zmiz2Q8CIE2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Zmiz2Q8CIE2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zmiz2Q8CIE2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Zmiz2Q8CIE2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zmiz2Q8CIE2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Zmiz2Q8CIE2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Zmiz2Q8CIE2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
Zmiz2Q8CIE2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zmiz2Q8CIE2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Zmiz2Q8CIE2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zmiz2Q8CIE2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Zmiz2Q8CIE2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zmiz2Q8CIE2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Zmiz2Q8CIE2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zmiz2Q8CIE2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Zmiz2Q8CIE2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Zmiz2Q8CIE2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Zmiz2Q8CIE2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Zmiz2Q8CIE2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Zmiz2Q8CIE2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zmiz2Q8CIE2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Zmiz2Q8CIE2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zmiz2Q8CIE2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zmiz2Q8CIE2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Zmiz2Q8CIE2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zmiz2Q8CIE2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Zmiz2Q8CIE2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zmiz2Q8CIE2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zmiz2Q8CIE2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zmiz2Q8CIE2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zmiz2Q8CIE2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zmiz2Q8CIE2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Zmiz2Q8CIE2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zmiz2Q8CIE2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zmiz2Q8CIE2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Zmiz2Q8CIE2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zmiz2Q8CIE2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zmiz2Q8CIE2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Zmiz2Q8CIE2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms