Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Cldn17Q8BXA6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Cldn17Q8BXA6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Cldn17Q8BXA6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Cldn17Q8BXA6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Cldn17Q8BXA6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
Cldn17Q8BXA6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Cldn17Q8BXA6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Cldn17Q8BXA6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Cldn17Q8BXA6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cldn17Q8BXA6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cldn17Q8BXA6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cldn17Q8BXA6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cldn17Q8BXA6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Cldn17Q8BXA6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Cldn17Q8BXA6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Cldn17Q8BXA6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cldn17Q8BXA6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cldn17Q8BXA6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cldn17Q8BXA6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cldn17Q8BXA6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cldn17Q8BXA6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cldn17Q8BXA6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cldn17Q8BXA6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cldn17Q8BXA6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Cldn17Q8BXA6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Cldn17Q8BXA6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cldn17Q8BXA6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cldn17Q8BXA6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cldn17Q8BXA6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cldn17Q8BXA6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cldn17Q8BXA6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cldn17Q8BXA6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cldn17Q8BXA6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cldn17Q8BXA6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cldn17Q8BXA6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cldn17Q8BXA6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cldn17Q8BXA6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cldn17Q8BXA6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cldn17Q8BXA6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cldn17Q8BXA6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cldn17Q8BXA6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cldn17Q8BXA6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cldn17Q8BXA6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cldn17Q8BXA6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cldn17Q8BXA6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cldn17Q8BXA6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cldn17Q8BXA6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cldn17Q8BXA6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cldn17Q8BXA6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cldn17Q8BXA6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cldn17Q8BXA6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cldn17Q8BXA6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cldn17Q8BXA6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Cldn17Q8BXA6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cldn17Q8BXA6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Cldn17Q8BXA6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cldn17Q8BXA6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cldn17Q8BXA6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cldn17Q8BXA6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cldn17Q8BXA6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cldn17Q8BXA6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cldn17Q8BXA6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cldn17Q8BXA6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cldn17Q8BXA6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cldn17Q8BXA6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cldn17Q8BXA6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cldn17Q8BXA6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cldn17Q8BXA6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cldn17Q8BXA6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cldn17Q8BXA6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cldn17Q8BXA6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cldn17Q8BXA6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cldn17Q8BXA6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cldn17Q8BXA6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Cldn17Q8BXA6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cldn17Q8BXA6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cldn17Q8BXA6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cldn17Q8BXA6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cldn17Q8BXA6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cldn17Q8BXA6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cldn17Q8BXA6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Cldn17Q8BXA6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cldn17Q8BXA6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cldn17Q8BXA6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cldn17Q8BXA6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cldn17Q8BXA6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Cldn17Q8BXA6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cldn17Q8BXA6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cldn17Q8BXA6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cldn17Q8BXA6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cldn17Q8BXA6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn17Q8BXA6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cldn17Q8BXA6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cldn17Q8BXA6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn17Q8BXA6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cldn17Q8BXA6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cldn17Q8BXA6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn17Q8BXA6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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