Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Amigo1Q80ZD8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Amigo1Q80ZD8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Amigo1Q80ZD8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Amigo1Q80ZD8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Amigo1Q80ZD8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Amigo1Q80ZD8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Amigo1Q80ZD8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Amigo1Q80ZD8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Amigo1Q80ZD8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Amigo1Q80ZD8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Amigo1Q80ZD8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Amigo1Q80ZD8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Amigo1Q80ZD8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Amigo1Q80ZD8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Amigo1Q80ZD8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Amigo1Q80ZD8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Amigo1Q80ZD8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Amigo1Q80ZD8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Amigo1Q80ZD8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Amigo1Q80ZD8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Amigo1Q80ZD8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Amigo1Q80ZD8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Amigo1Q80ZD8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Amigo1Q80ZD8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Amigo1Q80ZD8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Amigo1Q80ZD8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Amigo1Q80ZD8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Amigo1Q80ZD8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Amigo1Q80ZD8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Amigo1Q80ZD8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Amigo1Q80ZD8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Amigo1Q80ZD8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Amigo1Q80ZD8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Amigo1Q80ZD8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Amigo1Q80ZD8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Amigo1Q80ZD8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Amigo1Q80ZD8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Amigo1Q80ZD8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Amigo1Q80ZD8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Amigo1Q80ZD8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Amigo1Q80ZD8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Amigo1Q80ZD8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Amigo1Q80ZD8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Amigo1Q80ZD8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Amigo1Q80ZD8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Amigo1Q80ZD8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Amigo1Q80ZD8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Amigo1Q80ZD8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Amigo1Q80ZD8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Amigo1Q80ZD8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Amigo1Q80ZD8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amigo1Q80ZD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amigo1Q80ZD8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Amigo1Q80ZD8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amigo1Q80ZD8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Amigo1Q80ZD8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Amigo1Q80ZD8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Amigo1Q80ZD8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Amigo1Q80ZD8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Amigo1Q80ZD8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Amigo1Q80ZD8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Amigo1Q80ZD8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Amigo1Q80ZD8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Amigo1Q80ZD8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Amigo1Q80ZD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Amigo1Q80ZD8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Amigo1Q80ZD8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Amigo1Q80ZD8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Amigo1Q80ZD8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Amigo1Q80ZD8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Amigo1Q80ZD8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Amigo1Q80ZD8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Amigo1Q80ZD8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Amigo1Q80ZD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Amigo1Q80ZD8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Amigo1Q80ZD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Amigo1Q80ZD8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Amigo1Q80ZD8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Amigo1Q80ZD8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Amigo1Q80ZD8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Amigo1Q80ZD8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Amigo1Q80ZD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Amigo1Q80ZD8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Amigo1Q80ZD8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Amigo1Q80ZD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Amigo1Q80ZD8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Amigo1Q80ZD8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Amigo1Q80ZD8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Amigo1Q80ZD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Amigo1Q80ZD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Amigo1Q80ZD8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Amigo1Q80ZD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
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