Protein–RNA interactions for Protein: Q71KU9

Fgl1, Fibrinogen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgl1Q71KU9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
Fgl1Q71KU9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Fgl1Q71KU9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Fgl1Q71KU9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Fgl1Q71KU9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Fgl1Q71KU9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Fgl1Q71KU9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Fgl1Q71KU9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Fgl1Q71KU9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Fgl1Q71KU9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Fgl1Q71KU9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Fgl1Q71KU9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Fgl1Q71KU9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Fgl1Q71KU9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Fgl1Q71KU9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Fgl1Q71KU9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Fgl1Q71KU9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Fgl1Q71KU9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Fgl1Q71KU9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Fgl1Q71KU9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Fgl1Q71KU9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Fgl1Q71KU9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fgl1Q71KU9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fgl1Q71KU9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fgl1Q71KU9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fgl1Q71KU9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fgl1Q71KU9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fgl1Q71KU9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fgl1Q71KU9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fgl1Q71KU9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fgl1Q71KU9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fgl1Q71KU9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fgl1Q71KU9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Fgl1Q71KU9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Fgl1Q71KU9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fgl1Q71KU9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgl1Q71KU9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fgl1Q71KU9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fgl1Q71KU9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fgl1Q71KU9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fgl1Q71KU9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fgl1Q71KU9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fgl1Q71KU9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fgl1Q71KU9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fgl1Q71KU9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fgl1Q71KU9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Fgl1Q71KU9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Fgl1Q71KU9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fgl1Q71KU9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Fgl1Q71KU9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fgl1Q71KU9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fgl1Q71KU9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fgl1Q71KU9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Fgl1Q71KU9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgl1Q71KU9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fgl1Q71KU9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fgl1Q71KU9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Fgl1Q71KU9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fgl1Q71KU9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Fgl1Q71KU9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fgl1Q71KU9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fgl1Q71KU9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fgl1Q71KU9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fgl1Q71KU9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fgl1Q71KU9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fgl1Q71KU9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fgl1Q71KU9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fgl1Q71KU9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fgl1Q71KU9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgl1Q71KU9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fgl1Q71KU9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fgl1Q71KU9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgl1Q71KU9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgl1Q71KU9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fgl1Q71KU9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fgl1Q71KU9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fgl1Q71KU9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fgl1Q71KU9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fgl1Q71KU9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Fgl1Q71KU9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Fgl1Q71KU9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Fgl1Q71KU9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Fgl1Q71KU9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Fgl1Q71KU9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgl1Q71KU9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Fgl1Q71KU9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgl1Q71KU9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgl1Q71KU9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Fgl1Q71KU9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Fgl1Q71KU9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Fgl1Q71KU9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Fgl1Q71KU9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgl1Q71KU9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Fgl1Q71KU9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Fgl1Q71KU9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Fgl1Q71KU9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgl1Q71KU9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Fgl1Q71KU9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Fgl1Q71KU9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgl1Q71KU9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms